С именем Милошевича связана сложная и драматичная череда этнических конфликтов и гражданских войн, последовавших за распадом Югославии и приведших к масштабному военному вмешательству вооруженных сил НАТО.
В мае 1999 года Гаагский Международный трибунал по бывшей Югославии - МТБЮ, выдвинул обвинения против бывшего президента Югославии Слободана Милошевича в совершении военных преступлений в Косово в 1999 году.
Милошевич и четыре высших югославских руководителя обвинялись по пяти пунктам, квалифицированным как преступления против человечности - убийства, преследования по политическим, расовым и религиозным мотивам, депортации ‑ и по одному пункту, квалифицированному как нарушение законов и обычаев войны. Милошевич был арестован 1 апреля 2001 года в соответствии с югославским законодательством по обвинению в совершении уголовных преступлений.
Слободан Милошевич был предан МТБЮ и переведен в тюрьму ООН в Гааге 28 июня 2001 года. Судебный процесс начался 12 февраля 2002 года. В связи с ухудшением состояния здоровья бывшего президента процесс прерывался 22 раза. Милошевич скончался от сердечного приступа в тюрьме Гаагского трибунала 11 марта 2006 года, а 14 марта МТБЮ закрыл дело Милошевича.
В феврале 2002 года Милошевич произнес в Гааге длинную защитную речь, в которой дал опровержения по нескольким десяткам пунктов обвинения, а также зафиксировал несоответствие данного судебного процесса ряду международных правовых норм - то есть, фактически, его незаконность с точки зрения международного права.
Кроме того, в своей речи Милошевич дал развернутый анализ предыстории, истоков и хода войны НАТО против Югославии. Предъявил доказательства, в том числе фото- и видеоматериалы, ряда военных преступлений НАТО: использования запрещенных видов вооружений, таких как кассетные бомбы и боеприпасы с обедненным ураном, намеренное уничтожение невоенных объектов, многочисленные атаки гражданского населения.
В своей речи Милошевич также указал, что осуществляемые альянсом бомбардировки не имели и не могли иметь военного значения: так, в результате всех ракетно-бомбовых ударов на территории Косово было уничтожено всего 7 танков сербской армии.
Приводя факты, Милошевич указал, что в значительной части случаев ракетно-бомбовых ударов по гражданскому населению пострадавшими являлись этнические албанцы, и стремился доказать тезис о том, что массовые атаки НАТО против албанских крестьян не были непреднамеренными, а являлись обдуманной акцией, призванной спровоцировать их массовый исход из Косово в сопредельные государства.
Наличие масс албанских беженцев смогло бы в глазах мирового сообщества подтвердить обвинение сербов в геноциде албанцев - основной тезис, выдвинутый руководством НАТО в качестве основания для проведения «операции». Этой же цели, согласно Милошевичу, служили расправы албанских ополченцев над теми албанцами, кто не желал покидать Косово.
Из этого, в частности, Милошевич сделал вывод о полной согласованности действий албанских вооруженных формирований, с одной стороны, и руководства операцией НАТО, с другой. В качестве одного из доказательств этого тезиса, Милошевич привел листовки на албанском языке, в которых содержались призывы к албанскому населению бежать из Косово. Эти листовки разбрасывались с самолетов НАТО.
Текст защитной речи Милошевича дает широкий взгляд на драматические события, имевшие место в Сербии и в других бывших югославских республиках в 1990-е годы. Процесс по делу Милошевича не был закончен, так как подсудимый умер в тюрьме в Гааге, согласно результатам вскрытия, от инфаркта миокарда. Он был обнаружен тюремным персоналом без признаков жизни на кровати в своей камере в Схевенингене.