Приказом Министерства здравоохранения Российской Федерации от 2.04.1993 года № 65 в Кубанском медицинском институте на базе Краснодарского краевого клинического научно-методического центра матери и ребенка создана первая клиническая база - Базовая акушерско-гинекологическая клиника. Научным руководителем и организатором Клиники был профессор, доктор медицинских наук Борис Григорьевич Ермошенко. Первым главным врачом Клиники стал опытный врач-акушер-гинеколог Владимир Сергеевич Коденцов.

Клиника является основной гинекологической базой кафедры акушерства, гинекологии и перинатологии Кубанского государственного медицинского университета, имеющей все необходимые условия для обучения студентов 5-6-х курсов лечебного факультета, врачей-интернов, клинических ординаторов.

Помимо лечебной работы сотрудники Клиники активно занимаются научно-исследовательской деятельностью. Опубликовано свыше 500 печатных работ, получены два патента, разработано много рационализаторских предложений. Восемью сотрудниками на базе Клиники проведены исследования и защищены докторская и кандидатски диссертации. Участие в международных, всероссийских, региональных научных конгрессах, форумах, а также съездах акушеров-гинекологов стало традицией для врачей Клиники.

В Клинике работают высококвалифицированные врачи различных специальностей, в числе которых 2 доктора и 18 кандидатов медицинских наук, 41 врач высшей квалификационной категории.