При Екатеринодарской войсковой казачьей больнице в 1903 году было открыто психиатрическое отделение. Через тридцать лет оно было реорганизовано в краевую психоневрологическую больницу. Во время немецкой оккупации больница переименовывалась в психоневрологическое отделение 3-ей городской больницы, а с 01.10.1945 года вновь была восстановлена в своем статусе. Она является государственным бюджетным учреждением здравоохранения «Специализированная клиническая психиатрическая больница № 1» министерства здравоохранения Краснодарского края с 2011 года.

С апреля 2011 года больницу возглавляет доктор медицинских наук Елена Олеговна Бойко.
На сегодняшний день клиника рассчитана на 905 коек, в которой ежегодно проходят лечение более 7 тысяч пациентов, и является одним из крупнейших лечебно-профилактических учреждений Краснодарского края, выполняя функции организационно-методического центра краевой психиатрической службы.

Оснащение современным лечебно-диагностическим оборудованием и укомплектование высококвалифицированными кадрами позволяют оказывать в наименее ограничительных условиях, приближенной к европейскому уровню все виды психиатрической помощи: консультативная, лечебно-диагностическая, психопрофилактическая, реабилитационная, психотерапевтическая помощь во внебольничных и стационарных условиях, в том числе лицам, страдающим сопутствующей наркопатологией; психиатрическая, психотерапевтическая и психологическая помощь при стихийных бедствиях и катастрофах; все виды судебной психиатрической экспертизы, определение временной нетрудоспособности; медико-социальная помощь; консультации по правовым вопросам, связанным с оказанием психиатрической помощи.

Для всестороннего и полного обследования больных, оказания максимального объёма специализированной помощи больница располагает клинической и биохимической лабораториями, аптекой, отделением функциональной и лучевой диагностики, физиотерапевтическим отделением, лабораторией эксперементально-психологических исследований, стоматологическим, хирургическим, гинекологическим кабинетами, кабинетом иглорефлексотерапии, отделением эфферентных методик и гипербарической оксигенации, отделением реанимации и интенсивной терапии.

В штате больницы 921 сотрудников. Из них - 136 врачей, среди которых 1 доктор медицинских наук, 9 - кандидатов медицинских наук, 1 - кандидат психологических наук, 59 - имеют высшую квалификационную категорию, 19 человек - первую, 13 человек - вторую, 24 врача носят звание - отличник здравоохранения, 10 - заслуженный работник здравоохранения Кубани. Среди 228 медицинских сестер 61 имеют первую и высшую квалификационные категории, 9 человек высшее сестринское образование. На базе ГБУЗ "Специализированная клиническая психиатрическая больница №1" осуществляют работу две кафедры психиатрии Кубанского государственного медицинского университета.

Минздравом России ГБУЗ «Специализированная клиническая психиатрическая больница №1» в 2000 году была отнесена к лечебно-профилактическим учреждениям 1-ой категории.
В настоящее время приоритетом в деятельности больницы является совершенствование и развитие реабилитационного и профилактического направлений.

Психиатрическая служба Краснодарского края признана победителем 1 Всероссийского конкурса «За подвижничество в области душевного здоровья» в 2008 году.

Психиатрическая служба Краснодарского края в 2012 году вновь стала побидителем V юбилейного Всероссийского конкурса «За подвижничество в области душевного здоровья» имени акад. РАМН Т.Б. Дмитриевой за системное и масштабное развитие современных реабилитационных форм работы и высокий профессионализм, проявленный в Крымской трагедии.