Южное таможенное управление входит в единую федеральную централизованную систему таможенных органов Российской Федерации и обеспечивает реализацию задач и функций ФТС России в Южном федеральном округе. Регион деятельности ЮТУ охватывает территорию, в которую входят 6 административно-территориальных единиц ЮФО - субъектов РФ: республики Адыгея и Калмыкия; Краснодарский край; Астраханская, Волгоградская и Ростовская области. Площадь региона деятельности ЮТУ составляет 416 840 км2. Общая протяженность сухопутного участка Государственной границы РФ в регионе деятельности ЮТУ составляет 1 446,3 км. Протяженность морского участка границы РФ - 887,1 км (479 морских миль). Таможенные органы ЮТУ включают в себя 8 таможен и 50 таможенных постов. В регионе деятельности ЮТУ установлен 51 пункт пропуска через государственную границу Российской Федерации.
Руководство Южного таможенного управления
Пашко Сергей Викторович
Начальник Южного таможенного управления
Коптенко Виктор Васильевич
Первый заместитель начальника управления
Беляев Андрей Станиславович
Заместитель начальника управления, начальник службы федеральных таможенных доходов
Турко Алексей Николаевич
Заместитель начальника управления, начальник оперативной таможни
Воронов Александр Владимирович
Заместитель начальника управления, начальник правовой службы
Скрипкин Александр Анатольевич
Заместитель начальника управления
Иваненко Владимир Васильевич
Заместитель начальника управления, начальник кадровой службы
Эбель Виталий Евгеньевич
Заместитель начальника управления, начальник службы таможенного контроля после выпуска товаров
Астраханская таможня
Краснодарская таможня
Миллеровская таможня
Новороссийская таможня
Ростовская таможня
Сочинская таможня
Таганрогская таможня
Южная оперативная таможня