Разгерметизация корабля «Союз МС-09» возможно произошла из-за производственного брака. Об этом, 3 сентября 2018 года, сообщили СМИ со ссылкой на источники в ракетно-космической отрасли. Отмечается, что она возникла еще на Земле. Ответственный за халатность установлен.

По словам другого источника, сотрудник, скорее всего, после того, как осознал ошибку, заделал трещину специальным клеем, поэтому она не была обнаружена во время проверки космического корабля на герметичность перед запуском и не давала о себе знать первые два месяца орбитального полета. Однако в дальнейшем клей подсох и был выдавлен, открыв отверстие.

В пресс-службе государственной корпорации «Роскосмос» сообщили, что причины утечки воздуха на Международной космической станции будут названы после завершения работы комиссии, делать выводы до этого момента - преждевременно. Все будет обнародовано сразу после завершения расследования, не уточнив при этом, когда будет закончена работа. В пресс-службе добавили, что сейчас на МКС все находится в пределах нормы.

Утечку воздуха на МКС нашли в ночь на четверг, 30 августа. Экипаж проверил все отсеки и обнаружил микротрещину в космическом корабле «Союз МС-09». Она располагалась в бытовом отсеке, а не в спускаемом аппарате, поэтому не угрожала возвращению космического корабля на Землю. Первоначально считалось, что трещина образовалась из-за попадания микрометеорита. Вечером следующего дня российские космонавты закрыли отверстие специальным герметиком.

Ракетно-космическая корпорация «Энергия» начала внутреннее расследование. Кроме того, нештатную ситуацию расследует специальная комиссия из сотрудников «Роскосмоса», РКК «Энергия» и головного научного института ракетно-космической отрасли ЦНИИмаш.