Президент Российской Федерации Владимир Путин 15 февраля 2019 года, подписал Указ «О присвоении звания Героя Российской Федерации Ковтуну Владимиру Павловичу». Звание присвоено за героизм, мужество и отвагу, проявленные при выполнении специальных заданий в условиях, сопряженных с риском для жизни.

В Мельтанайском ущелье 5 января 1987 года, Ковтун будучи еще старшим лейтенантом, смог со своей разведгруппой, находившейся под общим командованием майора Евгения Сергеева, заместителя командира 186-го отряда СпН, первым захватить три образца американских ПЗРК «Стингер», которые американцы поставляли моджахедам, а также дипломат с документацией на них, включая адреса поставщиков из США.

Разведчикам удалось перехватить «Стингер» у афганских моджахедов, причем с инструкцией на английском языке и адресом отправителя в США, в результате чего Советский Союз получил доказательства того, что Соединенные Штаты снабжали исламистов новейшими образцами своего вооружения. Эти трофеи были показаны на срочной пресс-конференции в МИДе Афганистана как неопровержимое доказательство вмешательства Америки во внутренние дела страны.

За эту операцию командир вертолета капитан Соболь, старший лейтенант Ковтун и майор Сергеев были представлены к званию Героя Советского Союза. Только Владимир Павлович был против, он сказал, что отказывается от звания, ведь его командир достоин быть Героем больше, чем кто-либо из них. Он оказался прав, спустя много лет, 6 мая 2012 года подполковнику войск специального назначения Е.Г. Сергееву было присвоено звание Героя России.

Сам же Ковтун Владимир Павлович был награжден 15 февраля 2019 года, в день 30-летия вывода Российских войск из Афганистана, за мужество и отвагу, проявленные при выполнении специальных заданий в условиях, сопряженных с риском для жизни.