Ваха Агаев родился 15 марта 1953 года в городе Кызылорда, Казахстан.
В 1977 году окончил окончил исторический факультет Чечено-Ингушского государственного университета им. Л. Н. Толстого (ныне Чеченский государственный университет).
После выпуска из ВУЗа на протяжении года работал секретарем комитета комсомола. В 1981 году вступил в Коммунистическую партию Советского Союза (КПСС).
С 1984 года занимал разные должности в контрольно-ревизионном управлении Министерства финансов РСФСР по Чечено-Ингушской АССР.
Параллельно учился на экономическом факультете Московского кооперативного института Центросоюза (ныне Российский университет кооперации), который окончил в 1985 году.
В 1991 году переехал в Москву, где с 1992 года по 1995 год являлся генеральным директором ТОО «Лама». Затем до 1997 года был генеральным директором научно-производственного объединения «Школа», занимающегося издательской деятельностью.
С 1997 по 1998 год работал в должности председателя совета директоров Расчетно-кредитного банка. Банк находился в собственности семьи Агеева до 2018 года.
В 1998 году учредил и возглавил ООО «Юг-Нефтепродукт», главные активы которого были расположены в Краснодарском крае. В частности, холдинг владел акциями нефтеперерабатывающих заводов (НПЗ) в Краснодаре и Туапсе. В 2004 году долю в Туапсинском НПЗ (добытчик и экспортер чеченской нефти) купила нефтяная компания «Роснефть». В 2005 году Краснодарский НПЗ перешел под управление «Руснефти».
В 1999 году опубликовал свою книгу «Управленческий механизм обеспечения продовольственной безопасности».
В 2003 году и в 2007 году баллотировался в Государственную думу РФ IV и V созывов по списку КПРФ: сначала в составе Северо-кавказской региональной группы (Республика Ингушетия, Кабардино-Балкария, Северная Осетия, Чечня, Ставропольский край), затем - Усть-Лабинской (Краснодарский край). По результатам не прошел.
Активно занимался благотворительностью. В декабре 2009 года президент Чечни Рамзан Кадыров назвал Агаева в числе тех, кто вкладывал средства в восстановление республики. Он присвоил ему звание Почётного гражданина Республики Чечня за личный вклад в социально-экономическое развитие региона. Еще бизнесмен оказывал поддержку грозненскому футбольному клубу «Терек».
4 декабря 2011 года был избран депутатом Государственной думы РФ VI созыва от КПРФ в составе региональной группы №27 по Красноярскому краю. Вошел во фракцию коммунистов, стал заместителем председателя Комитета Госдумы по вопросам собственности.
На выборах 18 сентября 2016 года был избран Депутатом Государственной Думы VII созыва в составе федерального списка кандидатов, выдвинутого политической партией «Коммунистическая партия Российской Федерации». Член фракции политической партии КПРФ. Заместитель председателя комитета Государственной Думы по финансовому рынку.
За время исполнения депутатских полномочий выступил соавтором 42 законодательных инициатив и поправок к проектам федеральных законов.
Скончался 23 сентября 2020 года в Москве. Причиной смерти стали последствия коронавирусной инфекции.
Похоронен 25 сентября 2020 года на кладбище в родовом селении Рошни-Чу Урус-Мартановского района Чеченской Республики, где покоятся его родители.
На его похоронах присутствовал глава Чеченской Республики Рамзан Кадыров. Он выразил соболезнования родным и близким: «Ваха Абуевич был человеком слова и дела. Он всегда с уважением и огромным почтением относился к чеченским национальным традициям, всегда оставался верен им, несмотря ни на что. Он был глубоко верующим человеком, истинным патриотом нашего великого Отечества, принимал деятельное участие в возрождении Чеченской Республики, помогал людям, занимался благотворительностью».
Был женат. Воспитал двоих сыновей.
Сын - Бекхан Вахаевич Агаев, депутат Государственной Думы VI созыва от партии «Единая Россия».