Аркадий Бабченко родился 18 марта 1977 года в городе Москва. В 1995 году был призван в армию, проходил службу на Северном Кавказе, служил в войсках связи, принимал участие в первой чеченской войне. Уволен в запас в 1997 году. Позднее аркадий окончил юридический факультет Современного гуманитарного университета с дипломом бакалавра юриспруденции по международному праву.
После начала второй чеченской войны заключил контракт с Вооруженными силами Российской Федерации и принимал участие в контртеррористической операции. Служил связистом, затем в мотострелковых войсках, после командиром расчета в гранатометном взводе. В 2000 году уволен в запас в звании гвардии старшины. Занялся журналистикой.
Работал военным корреспондентом «Московского комсомольца», затем корреспондентом программы «Забытый полк», сотрудничал с газетами, журналами и телепередачами: «Крестьянская Россия», «Армейский магазин», «Постскриптум» и другими.
Временно оставив журналистику, несколько лет проработал таксистом, после чего устроился в «Новую газету» военным корреспондентом, но через некоторое время был уволен, по его собственному утверждению, за разгильдяйство. Был военным корреспондентом во время вооруженного конфликта в Южной Осетии в 2008 году. Аркадия Бабченко считают одним из основоположников современной военной прозы.
В марте 2012 года против Бабченко было возбуждено уголовное дело по статье 212 Уголовного кодекса Российской Федерации в связи с публикацией поста о возможной тактике митингующих «за честные выборы». Находится в оппозиции к действующей власти в России. Издатель журнала «Искусство войны».
В декабре 2016 года скандал вызвало высказывание Бабченко о катастрофе Ту-154 над Черным морем. Журналист выразил мнение, что летевшие в Сирию артисты ансамбля имени Александрова недостойны сожаления. После этого его подвергли критике депутат Виталий Милонов и сенатор Франц Клинцевич, призывавшие возбудить против него уголовное дело и даже лишить гражданства.
В феврале 2017 года Бабченко вместе с супругой и дочерью уехал из России в Чехию, затем проживал в Израиле. В августе 2017 года журналист со своей семьей переехал на Украину, где он вел программу «Prime: Бабченко» на крымско-татарском канале ATR.
Службой безопасности Украины 29 мая 2018 года была совершенна инсценировка покушения на российского журналиста Аркадия Бабченко, в связи с этим в СМИ появилась информация об его смерти от огнестрельного ранения. Но уже на следующий день эту информацию опровергли.