Бенуа Жако родился 5 февраля 1947 года в городе Париж, Франция.
В 17 лет интеллектуал и киноман Бенуа Жако стал ассистентом режиссера на съемках одного из фильмов об Анжелике. В начале 70-х годов Жако работал на телевидении, где снимал документальные фильмы и экранизации художественных произведений. Также Бенуа Жако принимал участие в создании экспериментальных картин Маргерит Дюрас «Натали Гранже» и «Песня Индии».
Дебютным полнометражным кинофильмом Бенуа Жако стала драма «Музыкант-убийца», основанная на повести Достоевского «Неточка Незванова». В том же ключе был снят и второй фильм Бенуа Жако - «Дети из шкафа». Настоящий успех режиссеру принесла мелодрама «Крылья голубки», главную роль в которой исполнила Изабель Юппер.
В 1997 году Бенуа Жако представил драму «Седьмое небо», номинированную на премию Венецианского кинофестиваля «Золотой лев». В 1998 году он снял картину «Школа плоти» с Изабель Юппер, а в 2002 году - драму «Адольф» с Изабель Аджани. Основная тема фильмов Бенуа Жако остается неизменной - любовь. Однако стилистическое разнообразие его работ поражает. В 2000 году один из самых плодовитых режиссеров современной Франции снял костюмную драму о маркизе де Саде, в 2001 году создал киноверсию оперы «Тоска». В 2004 году он вновь удивил зрителей, сняв стилизованный черно-белый триллер «До скорого» - история девушки, которая уходит в бега вместе с возлюбленным-бандитом.
В 2009 году состоялась премьера фильма Жако «Вилла Амалия» - экранизации бестселлера Паскаля Киньяра с Изабель Юппер в главной роли, а в 2010 году увидела свет драма «В лесной чаще». Фильм «Прощай, моя королева», получил десять номинаций премии «Сезар» 2013 года и открывал 62-й Берлинский международный кинофестиваль в феврале 2012 года. В 2018 году вышел новый фильм Бенуа «Ева», главную роль в котором, также исполнила Изабель Юппер.