Владимир Болдырев родился 8 апреля 1927 года в городе Томск. После окончание школы высшее образование получил в 1948 году в Томском государственном университете. Профессиональный путь начал в том же ВУЗе. Основным направлением научной деятельности стало изучение реакционной способности твердых веществ с целью поиска способов управления химическими реакциями, проходящими в твердом состоянии.
В 1962 году Болдырев успешно защитил диссертацию на соискание ученой степени доктора химических наук. В следующем году, по рекомендации академика Н.Н. Семенова перешел на работу в Институт химической кинетики и горения СО АН СССР, где организовал лабораторию кинетики химических реакций в твердой фазе. Еще через два года стал профессором и членом Ученого совета Новосибирского государственного университета.
В 1975 году переведен в Новосибирский Институт физико-химических основ переработки минерального сырья Сибирского отделения РАН. С 1976 по 1998 года занимал должность директора Института физико-химических основ переработки минерального сырья СО РАН. С 1978 являлся ответственным редактором журнала «Известия Сибирского отделения РАН. Серия химических наук».
Владимир Вячеславович с 1988 по 1997 года занимал пост президента Международной механохимической ассоциации при Международном союзе теоретической и прикладной химии. В 1991 году избран Академиком РАН по Секции химических и медико-биологических наук.
С 1992 по 1996 года возглавлял Международный консультативный комитет по реакционной способности твердых веществ. Через два года стал Советником РАН.
В 2002 году 21 марта провел LVIII Менделеевские чтения по теме «Реакционная способность твердых веществ. проблемы и перспективы».
Болдырев является членом бюро Европейской ассоциации по прикладной физической химии, иностранным членом Японского общества порошковой технологии, Американского химического общества и Российской академии естественных наук. Входит в состав Национального комитета российских химиков.
Химик обнаружил явление обратной связи, позволившее наметить эффективные методы управления химическими реакциями в твердой фазе при известном механизме реакции, путём создания или, наоборот, уничтожения дефектов, варьированием способов получения твердого вещества и методов его предварительной обработки. Найденный подход позволил решить и обратную задачу: по тому, как влияют на реакционную способность твердого вещества отдельные виды дефектов в кристаллах, можно сделать выводы об особенностях механизма реакции.
Женат. Воспитал двоих детей.
Лауреат Государственной премии РФ за цикл работ по механической активации оксидных и металлических систем.