Государственный деятель. Президент Республики Македония с 1999 по 2004 год. Являлся председателем Комиссии внешнеполитических отношений Внутренней македонской революционной организации - Демократическая партия за македонское национальное единство.
Борис Трайковский родился 25 июня 1956 года в селе Муртино, Республика Северная Македония. В 1980 году окончил юридический факультет в городе Скопье. Затем переехал в США, где женился и работал методистским священником.
После возвращения в Македонию, с 1991 года Трайковский являлся одним из активистов партии Внутренняя македонская революционная организация - Демократическая партия за македонское национальное единство и соратником ее лидера Любчо Георгиевского. До 1997 года руководил юридической службой строительного предприятия «Слобода» в Скопье.
Затем Борис Трайковский возглавлял администрацию мэра района Кисела Вода - Скопье. Позднее с 1998 по 1999 год являлся заместителем министра иностранных дел в кабинете Любчо Георгиевского. Играл ключевую роль на переговорах, связанных с проблемой размещения албанских беженцев из Косово на территории Македонии.
Также Трайковский являлся председателем Комиссии внешнеполитических отношений Внутренней македонской революционной организации - Демократическая партия за македонское национальное единство. Затем стал главным политическим советником по внешней политике председателя партии. После победы ВМРО-ДПМНЕ на парламентских выборах и формирования правительства Георгиевского выдвинут кандидатом на пост президента от этой партии.
Во втором туре президентских выборов 5 декабря 1999 года Борис Трайковский избран президентом Македонии. За него проголосовало около 53 % избирателей.
Самолет президента, который направлялся в Боснию и Герцеговину для участия в международной конференции, разбился 26 февраля 2004 года, упав на склоны горы Хргуд. Авиакатастрофа произошла в горной местности в Герцеговине. Кроме президента Македонии погибли несколько сотрудников его администрации. Похоронен Борис Трайковский 5 марта 2004 года на городском кладбище Скопье.
Супруга - Вилма Трайковская
Сын - Стефан
Дочь - Сара.