Джейк Марк Джонсон родился 28 мая 1978 в Эванстоне - северном пригороде Чикого, штат Иллинойс, США, в семье с ирландскими корнями. Его воспитывала мать-одиночка, художница, по большей части изготавливающая витражи. Джонсон вырос настоящим фанатом группы импровизаторов «Second City», которая обязана открытием таланта таких актеров, как Джон Белуши, Тина Фей и Крис Фарли.
Джейк окончил среднюю школу «Нью-Трир» в деревне Уиннетка, округ Кук, штат Иллинойс и продолжил свое обучение в Университете штата Айова. Пребывая в Айова-Сити, Джонсон написал пьесу, которая привела его прямиком в драматический отдел престижной «Школы искусств Тиш» при Нью-Йоркском университете.
В 2002 году Джонсон выиграл награду «John Golden Playwriting Prize», вручаемую авторам превосходных сценариев. Его пьеса «Cousins» была поставлена нью-йоркской внебродвейской труппой «The Ensemble Studio Theater».
Будучи в Нью-Йорке, Джонсон начал работу с комедийной командой «The Midwesterners». После просмотра скетч-сериала телеканала HBO «Господин Шоу с Бобом и Дэвидом» сценарист точно знал, как переделать репертуар «The Midwesterners» и поработать над новым стилем.
После переезда в Лос-Анджелес, штат Калифорния, Джонсон устроился на работу официантом и был ассистентом режиссера. Помимо этого, он снялся в нескольких телепроектах. В 2007 году он получил более-менее стабильную работу - выступал с комическими номерами в веб-сериале «Дерек и Саймон» Боба Оденкёрка.
В 2009 году актер попал в состав псевдодокументального фильма «Бумажное сердце» с Майклом Сера. Через год он сыграл небольшую роль джазмена в музыкальной комедии «Побег из Вегаса». Он появился в образе Тедди, брата-недотепы Умы Турман, в романтической комедии «Свадьба».
Затем он снялся в фильме «Больше чем секс», в роли друга Эштона Катчера. В 2011 Джонсон попал в актерский ансамбль комедии «Убойное Рождество Гарольда и Кумара». В 2012 году его пригласили в полную циничного юмора комедию «Мачо и ботан», где главные роли сыграли Джона Хилл и Чаннинг Татум.
Джонсон получил одну из главных ролей в фильме «Безопасность не гарантируется» 2012 года, который стал участником кинофестиваля «Sundance». В 2013 году актер появился в клипе на песню «Rouse Yourself» инди-соул группы «JC Brooks & the Uptown Sound», в этом же клипе снялась американская актриса Обри Плаза.
Среди последних проектов с участием Джонсона - драма «Собутыльники», комедийная драма «Хорошенькая», комедия «Соседи. На тропе войны» и комедийный экшн «Типа копы». В 2017 году на экраны выйдет еще один фильм с участием актера «Мумия» - перезапуск серии фильмов о мумии.
Джонсон проживает в Лос-Анджелесе вместе со своей женой, художницей Эрин Пэйн. Джонсон любит баскетбол и теннис, является членом обеих Баскетбольных Лиг и пяти теннисных ассоциаций.