Джонни Ли Миллер родился 15 ноября 1972 года в пригороде Лондона, Англия. Вырос в семье помощника режиссера-актрисы и театрального деятеля. В детстве Джонни и его сестру родители часто брали в телецентр на съемки популярных передач английского телевидения. Учась в школе, парень уже проявлял интерес ко всему, что было связано с кино, театром и телевидением. Кроме того, юноша увлекался игрой на саксофоне. В семнадцатилетнем возрасте Джонни начал работать билетером в театре, и собирался при этом стать профессиональным актером - продолжателем семейной традиции.
В начале актерской карьеры Джонни Ли Миллер играл небольшие роли в британских телесериалах, включая «Инспектор Морс» 1991 года. Первой же его серьезной кинематографической работой стала роль Дэйда Мерфи в культовом фильме 1995 года режиссера Айэна Софтли «Хакеры». Эта картина, несмотря на небольшие кассовые сборы, обеспечила Джонни популярность у молодежной аудитории. Актер сыграл в паре с начинающей тогда актрисой Анжелиной Джоли. Фильм имел огромный успех как у зрителей, так и у критиков.
После популярных «Хакеров» Джонни сыграл ведущую роль в драме 1996 года «На игле», которая принесла актеру уже реальную кино славу. Лента была создана по роману Ирвина Уэлша. Миллеру досталась главная роль парня по прозвищу Псих. В фильме зрители увидели дикую смесь необузданного бунтарства и черного юмора. Другие ведущие роли не менее ярко отработали актеры: Эван МакГрегор, Юэн Бремнер и Кевин МакКидд.
В течение последующих лет талантливый актер снялся в нескольких довольно успешных фильмах, в частности в мистическом фильме «Дракула 2000». Партнерами Миллера на съемочной площадке на этот раз были актеры: Джерард Батлер, Кристофер Пламмер и Витамин Си. По сюжету картины банда воров, оснащенная по последнему слову техники, проникла в хранилище известного лондонского антиквара Ван Хельсинга.
В 2004 году Джонни Миллер, Эйон Бэйли, Клифтон Коллинз младший и Вэл Килмер блестяще сыграли главные роли в триллере «Охотники за разумом». Действие фильма происходило на удаленном острове, где семь будущих агентов ФБР проходили решающий тест, чтобы попасть в элитный отдел «охотников за разумом».
Как-то Джонни Ли Миллер «обронил фразу», которая стала его жизненной позицией в дальнейшей карьере: «Мне неуютно быть знаменитостью… Мне не интересно такое внимание. Я хочу стать просто хорошим актером, который занимается своим делом и не устраивает ажиотажа вокруг собственной персоны». Все так и произошло. Актер стал знаменитым и на экраны ежегодно выходили фильмы с его участием.
В 2005 году Джонни Миллер ярко заявил о себе в фантастическом фильме «Эон Флакс» классически талантливо вписавшись в группу актеров: Шарлиз Терон, Мартон Ксокас и Софии Оконедо. Действие фильма затрагивало события 25 века. Из-за размножения смертоносного вируса, группа людей оказалась в изоляции в городе, где постепенно начинал созревать серьезный конфликт политической природы.
Джонни Ли Миллер - один из тех актеров, который при не харизматичной и даже снобической внешности способен на выдающиеся роли очаровательных авантюристов, героев и «безумцев». Биографическая драма 2006 года «Летучий шотландец» рассказала правдивую историю знаменитого шотландского велосипедиста, чемпиона мира Грэма Обри, который был известен тем, что установил мировой рекорд на велосипеде собственного производства.
По словам Джонни Ли Миллера он - «очень серьезный индивидуум», и на этом актер акцентировал внимание в своих фильмах. В его послужном списке множество фильмов, в том числе драма телекомпании ВВС «Конец игры», снятая в 2009 году по произведению Джейн Остин «Эмма». События фильма разворачивались в Южной Африке в конце 1980-х годов. Весь мир требовал отмены жестокого режима, но дело никак не сдвигалось с мертвой точки.
Джонни Ли Миллер был женат дважды. В 1995 году знаменитый актер сочетался узами брака с очаровательной, и неменее популярной Анжелиной Джоли, с которой познакомился на съемках фильма «Хакеры». После двух лет супружеской жизни они расстались. Причины развода не разглашались. Второй раз Джонни Ли Миллер женился в 2008 году, а его избранницей стала американская актриса и бывшая фотомодель Мишель Хикс. 3 декабря 2008 года у семейной пары родился сын Бастер Тимоти Миллер.