Сергей Францев родился 17 марта 1959 года в городе Курск. Свою тренерскую карьеру Францев начинал детско-юношеским тренером команды Ленинградского металлического завода. В 1991 году являлся главным тренером команды «Кировец».

В 1992-1993 годах возглавлял черняховский «Прогресс», в 1994-1996 годах - петербургскую «Смену-Сатурн». В 1996-1997 годах был главным тренером «Металлурга» Пикалево, с которым занял первое место в КФК, зона «Северо-Запад». В 1997-1998 годах - главный тренер орехово-зуевского «Спартака», с которым стал победителем второго дивизиона и вышел в первый дивизион.

В 2000 году работал помощником главного тренера в могилевском «Торпедо-Кадино». В 2001 году возглавлял сборную Ленинградского военного округа, с которой стал чемпионом Вооруженных сил России.

В 2001-2002 годах тренировал минское «Торпедо-МАЗ». В период с 2002 года по 2004 год работал помощником Олега Долматова в «Динамо» СПб, полтавской «Ворскле» и ярославском «Шиннике». В 2005 году был сначала генеральным директором, а затем и главным тренером в нижегородской «Волге».

В 2006 году был помощником Олега Долматова в московском «Локомотиве». В 2007-2009 годах являлся менеджером по селекции и помощником того же Долматова в «Ростове». В 2010 году возглавлял «Динамо», а в 2011 году - калининградскую «Балтику». С 5 июля 2011 года по 16 апреля 2012 года был помощником Олега Долматова в «Химках». 14 мая 2012 года возглавил «Авангард» из родного Курска. 17 апреля 2013 года, после домашнего поражения от саратовского «Сокола», подал в отставку.

В конце мая 2015 года был отправлен в отставку в эстонском клубе «Калев» Силламяэ, с которым в сезоне 2014 года завоевал серебряные медали чемпионата Эстонии.