Ляля Габбасова родилась 27 апреля 1957 года в городе Челябинск. В период с 1976 по 1982 год, обучалась в Челябинском государственном медицинском институте, а позднее - в Читинском государственном медицинском институте по специальности «Лечебное дело».
В 1982 году, Габбасова продолжила обучение в интернатуре Челябинского государственного медицинского института, а затем обучалась в ординатуре в Уральской государственной медицинской академии дополнительного образования. В период с 1992 по 2008 год, прошла путь от сотрудника кафедры терапии, клинической фармакологии и эндокринологии до профессора кафедры Уральской государственной медицинской академии дополнительного образования.
Педагогическую деятельность, Ляля Адыгамовна совмещала с практической работой. В 1997 году, защитила кандидатскую диссертацию по специальности кардиология. С 2004 года, Габбасова находилась на государственной службе в Минздраве Челябинской области, занимая должность начальника отдела стандартизации и управления качеством в здравоохранении.
В 2006 году, Габбасова Ляля защитила докторскую диссертацию по специальности фармакология, клиническая фармакология. С 2008 года, являлась заместителем директора, а впоследствии заняла пост директора Департамента высокотехнологичной медицинской помощи государственной службы в Министерстве здравоохранения и социального развития России.
С 2012 по 2013 год, занимала должность директора Департамента специализированной медицинской помощи и стандартизации в здравоохранении Министерства здравоохранения Российской Федерации. В апреле 2013 года, Габбасова Ляля Адыгамовна назначена на должность помощника Министра Здравоохранения Российской Федерации.
В разные периоды медицинской работы, научной и общественной деятельности, Ляля Адыгамовна отмечена государственными наградами и знаками отличия. Является лауреатом различных премий.
Замужем. Воспитала двоих сыновей.