Иоганн Фридрих Струэнзе родился 5 августа 1737 года в городе Галле, Германия. Через принцессу Луизу-Августу Датскую, официально признанную дочерью Кристиана VII, Струэнзе являлся предком королей Швеции Карла XVI Густава и Испании Филиппа VI. Молодого Иоганна, избравшего профессию врача, в 1768 году назначили сопровождать в заграничном путешествии молодого короля Кристиана VII. Многостороннее образование, ум, дарования и светские манеры скоро упрочили его положение при молодой королевской чете.

По возвращении из путешествия Струэнзе стал настолько быстро подвигаться по лестнице придворных должностей и рангов, что в 1770 году в его руках оказалась высшая государственная власть. В Кристиансборгский дворец переехал жить 17 января 1770 года, примерно в этот же период началась его интимная связь с королевой Каролиной Матильдой.

Струэнзе предоставили полномочие издавать от имени короля указы и рескрипты. Указы эти скреплялись печатью тайного королевского кабинета и имели силу указов, скрепленных подписью короля. Получив такую власть, принялся править страною с беспримерной энергией и смелостью. В два года его правления им было намечено и отчасти проведено до 600 более или менее крупных государственных мероприятий.

Реформы государственного деятеля сводились к следующему: свободе печати, стремлению достигнуть в деятельности высших органов правительственной власти большей быстроты, порядка и простоты, установлению твердого государственного бюджета, упорядочению государственных финансов, улучшению судопроизводства, отмене пыток, уничтожению покровительственной системы, поднятию земледелия и другое. Многие реформы основывались на здоровых, разумных началах, другие стали преждевременными. Все это создало множество тайных и явных врагов.

В ночь на 17 января 1772 года, после придворного бала, вдовствующая королева с наследным принцем и их приверженцы вошли в спальню короля, разбудили его и заставили подписать приготовленные Гульдбергом указы об арестах. Вслед за тем Струэнзе и его главного сотрудника Эневольд Брандт арестовали и заключили в крепость, а королеву Каролину Матильду отвезли в замок Кронборг.

Назначили особую комиссию для следствия и суда над Иоганном, там сразу сознался в своей связи с королевой, и его вместе с Брандтом приговорили к лишению чести и смертной казни. Приговор привели в исполнение 28 апреля 1772 года в Королевстве Дания.

Картина датского художника Кристиана Цартмана «Сцена при дворе Кристиана VII» изображает любовный треугольник короля, его фаворита и королевы. Его биография легла в основу нескольких литературных произведений: драма Поля-Жюля Барбье«Принцесса и фаворит», превращенная его сыном Пьером Барбье в либретто «Струэнзе»; роман австрийского писателя Роберта Нойманна «Фаворит королевы»; роман Пера Улова Энквиста «Визит лейб-медика».

О Струэнзе сняты несколько фильмов: немецкого режиссера Людвига Вольфа «Любовь королевы»; британского режиссера Виктора Сэвилла «Диктатор»; немецкого режиссера Харальда Брауна «Властитель без короны»; датского режиссера Николая Арселя «Королевский роман».