Сергей Караганов родился в 1958 году. Окончил в 1981 году Хабаровский политехнический институт, получив специальность «автомобили и автомобильное хозяйство». Дополнительно получил второе, юридическое образование окончив в 1998 году Хабаровский государственный технический университет.
С 1974 по 1975 год и с 1981 по 1983 год трудился в тресте "Сахалинспецнефтестрой" автослесарем и механиком управления строймеханизации и транспорта.
В 1981 году окончил Хабаровский политехнический институт по специальности «автомобили и автомобильное хозяйство»,
С 1983 по 1988 год проработал в Охинском городском комитете ВЛКСМ, пройдя путь от инструктора до первого секретаря горкома. В 1988-1998 годах был директором профессионального лицея.
В 1998 году окончил Хабаровский государственный технический университет по специальности «юриспруденция».
С 1998 по 2000 годы - начальник отдела кадров ОАО «Роснефть-Сахалинморнефтегаз».
С 2000 по 2006 годы - директор Департамента кадров «Роснефти».
С 2006 по 2014 годы - вице-президент НК «Роснефть», отвечающий за кадровую и социальную политику компании, формирование и реализацию политики корпоративной культуры, а также за вопросы развития внутренних коммуникаций.
С июля 2014 года по апрель 2015 года являлся заместителем Губернатора Сахалинской области - руководителем аппарата Губернатора и Правительства Сахалинской области.
В апреле 2015 уволился по собственному желанию.