Сергей Хабаров родился 9 февраля 1973 года в селе Шаромы, Камчатский край. В 1995 году, окончил Калининградское высшее военно-морское училище по специальности «радиоинженер». Позднее, получил дополнительное образование, успешно завершив курс обучения в филиале ГОУ ВПО «Дальневосточная академия государственной службы» по образовательной программе «Государственное и муниципальное управление».
Непосредственно по окончании военного ВУЗа, продолжил службу в Вооруженных Силах, где вплоть до 2004 года замещал различные командные и начальствующие должности.
C августа по октябрь 2004 года, являлся начальником по ГО и ЧС, и инженером по охране труда по совместительству в МУЗ «Городская гериатрическая больница».
Далее, с 2004 по 2005 год, работал в качестве специалиста 1 категории по ГО и ЧС управления здравоохранения города Петропавловск-Камчатский.
С марта 2005 по декабрь 2007 года, занимал должность консультанта и начальника военно-мобилизационного отдела аппарата администрации Камчатской области.
Затем, на протяжении 2008 года, опытный управленец возглавлял отдел по военно-мобилизационной работе и ЧС Министерства специальных программ Камчатского края.
Начиная с 2008 года, служил на посту Министра специальных программ Камчатского края, а с мая 2011 года, являлся Министром специальных программ и по делам казачества региона.
Впоследствии, 7 июля 2014 года, Хабаров Сергей Иванович назначен на должность заместителя Председателя Правительства Камчатского края - Министром специальных программ и по делам казачества Камчатского края.