Кодзуи Отани родился 27 декабря 1876 года. В европейской литературе Кодзуи Отани известен как «граф Отани», поскольку принадлежал к родовой знати, а в японской литературе - как 22-й настоятель Западного монастыря Хонган-дзи.
В молодости он много путешествовал по Европе, образование получил в Лондоне. Это позволило Отани познакомиться со многими путешественниками-исследователями, такими как Свен Гедин, Аурель Стейн и Альберт фон Ле Кок. Знакомства сильно повлияли на Кодзуи, потому он принял решение исследовать Восточный Туркестан, регион, сыгравший важную роль в распространении буддизма. Отани хотел обнаружить старинные тексты буддийских сутр. В 1902-1910 годах Отани Кодзуи финансировал три экспедиции в Центральную Азию.
Самым значительным достижением организованных Отани экспедиций считается археологическое исследование древнего города Субаши в пустыне Такла-Макан. Лично ему удалось поучаствовать лишь в первой экспедиции.
В связи с наследованием обязанностей настоятеля Западного монастыря Хонган-дзи в 1903 году, он был вынужден прекратить участие в исследованиях. В качестве настоятеля он продолжал организацию экспедиций. Также Кодзуи совершил модернизацию буддийской школы Дзёдо-синсю в Киото. Расходы на экспедиции повлекли за собой долги Дзёдо-синсю. В 1914 году, в результате возникшего финансового скандала Отани вынужден был отречься от поста настоятеля.
В период Второй мировой войны Отани Кодзуи был советником на оккупированных Японией территориях Китая, Маньчжоу-го, и побывал в советском плену в 1945-1947 годах. Скончался 5 октября 1948 года от рака желудка.