Владимир Колыбабинский родился 4 апреля 1963 года в селе Пасынки, Украина. Окончил среднюю школу. В 1984 году, успешно окончил Рязанское высшее воздушно-десантное командное училище. С 1984 года командовал парашютно-десантным взводом в 104-м гвардейском парашютно-десантном полку.

С ноября 1985 года по декабрь 1987 года, участвовал в боевых действиях в Афганистане, был командиром взвода и роты в 350-м гвардейском парашютно-десантном полку, входившем в состав ограниченного контингента советских войск. Во главе своего подразделения, Владимир Колыбабинский провел без потерь в личном составе несколько десятков боевых операций. Наибольшего успеха добился в марте 1987 года, когда его рота уничтожила крупную банду и захватила принадлежавший этой банде склад вооружения.

В декабре 1994 года, уже на должности начальника штаба парашютно-десантного полка, гвардии майор Колыбабинский в составе колонны десантников выдвигался к столице Чеченской республики городу Грозный. 28 декабря 1994 года у села Алхан-Кала колонна попала под мощный огонь боевиков из засады. Сразу были сожжены две автомашины, погибли 16 и получили ранения 6 бойцов, в том числе командир подразделения. Под шквальным огнем начальник штаба не растерялся, принял командование на себя. Преодолев замешательство, десантники открыли ответный огонь, огонь врага был подавлен, уничтожено орудие боевиков вместе с расчетом.

Руководя боем, Колыбабинский заметил, что огонь засады врага поддерживали еще из одной позиции. Там оказался целый укрепленный пункт боевиков, хорошо оборудованный и замаскированный. Во главе взвода ВДВ выдвинулся к нему и атаковал его при поддержке танка и самоходной зенитной установки. Здесь ход боя был уже иным, благодаря решительности командира ,гарнизон «дудаевцев» бежал, были захвачены 2 гаубицы, 2 миномета, 3 крупнокалиберных пулемета, уничтожена 1 БМП. На месте боя остались 30 трупов врагов. Наши потери - 2 убитых, 4 раненых.

Осмотревшись на местности, Владимир Колыбабинский приказал организовать круговую оборону на захваченном укрепленном пункте. Враг мог попытаться отбить ее с целью задержать наступление российских войск на город Грозный. Так все и произошло. Вскоре десантники уже отражали вражескую контратаку. В ней десантники уничтожили еще свыше 10 «дудаевцев», теперь уже без потерь со своей стороны. Укрепленный пункт был удержан.

С 7 по 17 января подразделение Колыбабенского удерживало захваченные рубежи. Только за трое суток было отбито 14 вражеских атак. Когда в одном из боев превосходящим силам врага удалось ворваться на позиции десантников, поднял бойцов в контратаку. Потеряв 14 человек убитыми, противник бежал. В том бою командир лично вытащил из-под вражеского огня двоих тяжелораненых подчиненных.

Указом Президента Российской Федерации от 28 августа 1995 года за мужество и героизм, проявленные при выполнении специального задания гвардии майору Колыбабинскому Владимиру Николаевичу присвоено звание Героя Российской Федерации.

Живёт в городе Москва.