Депутат Государственной Думы. Член Всероссийской политической партии «Единая Россия». Генерал армии. Являлся членом комитета Парламента по безопасности и противодействию коррупции, а также входил в комиссию по рассмотрению расходов федерального бюджета, направленных на обеспечение национальной обороны, национальной безопасности и правоохранительной деятельности. Занимал должность заместителя председателя комиссии Госдумы по правовому обеспечению развития организаций оборонно-промышленного комплекса России.
Николай Ковалев родился 6 августа 1949 года в городе Москва. После школы, в 1972 году окончил Московский институт электронного машиностроения, после чего работал инженером-конструктором в Конструкторском бюро полупроводникового машиностроения.
С 1974 года Николай Дмитриевич находился на службе в Комитете Государственной Безопасности СССР. Прошел путь от младшего оперативного уполномоченного Первомайского районного отдела УКГБ по городу Москве и Московской области до заместителя директора Федеральной службы безопасности России. Дважды принимал участие в боевых действиях в составе ограниченного контингента Вооруженных Сил СССР в Афганистане.
Ковалев, с 1990 года на протяжении четырех лет являлся заместителем начальника Управления КГБ по городу Москве и Московской области. В 1994 году стал заместителем директора Федеральной Службы Контрразведки России.
Указом Президента России №965 от 20 июня 1996 года назначен исполняющим обязанности директора Федеральной службы безопасности Российской Федерации. С 9 июля 1996 по 25 июля 1998 года Ковалев Николай Дмитриевич занимал должность директора ФСБ России.
В 1998 году стал заместителем директора концерна «Научный центр» в городе Зеленоград. С 23 февраля 1998 года являлся Генералом армии запаса. Через год, Ковалев избрался депутатом Государственной Думы России III созыва от Орловской области. Занимал посты заместителя председателя комитета по безопасности и председателя Комиссии по борьбе с коррупцией.
Через пять лет стал депутатом Государственной Думы IV созыва, а в 2007 году избрался депутатом Госдумы V созыва. Входил во фракцию «Единая Россия». Являлся председателем Комитета ГД по делам ветеранов, по борьбе с коррупцией, по вопросам профилактики безнадзорности, беспризорности и наркомании среди несовершеннолетних и молодежи.
Параллельно выступал Представителем от Государственной Думы III, IV и V созывов в Постоянной делегации ФС РФ в Парламентской ассамблее Совета Европы. Член Генерального совета Всероссийской политической партии «Единая Россия». Академик Российской академии естественных наук. Автор ряда книг и публикаций о деятельности спецслужб, проблемах обеспечения экономической безопасности, борьбы с терроризмом и коррупцией. Председатель экспертного совета Общероссийской общественной организации «Офицеры России».
В декабре 2011 года Ковалев переизбран депутатом Государственной Думы VI созыва. Входил в Комитет Парламента по безопасности и противодействию коррупции. Являлся председателем Комиссии по контролю за достоверностью сведений о доходах, об имуществе и обязательствах имущественного характера, представляемых депутатами Государственной Думы.
На выборах 18 сентября 2016 года Николай Дмитриевич Ковалев избран Депутатом Государственной Думы VII созыва от избирательного округа 0145, Орловский - Орловская область. Член фракции «Единая Россия». Член комитета Парламента по безопасности и противодействию коррупции. Член комиссии Госдумы по рассмотрению расходов федерального бюджета, направленных на обеспечение национальной обороны, национальной безопасности и правоохранительной деятельности. Заместитель председателя комиссии ГД по правовому обеспечению развития организаций оборонно-промышленного комплекса России.
Николай Дмитриевич Ковалев скончался 5 апреля 2019 года на семидесятом году жизни после продолжительной болезни. Похоронен генерал-армии с воинскими почестями через три дня на Федеральном военном мемориальном кладбище в подмосковье.
Орден «За заслуги перед Отечеством» III степени (20 апреля 2006) - за большой вклад в законотворческую деятельность и многолетнюю добросовестную работу
Орден «За заслуги перед Отечеством» IV степени
Орден «За военные заслуги»
Орден Почета (30 апреля 2014 года) - за достигнутые трудовые успехи, значительный вклад в социально-экономическое развитие Российской Федерации, заслуги в гуманитарной сфере, укреплении законности и правопорядка, многолетнюю добросовестную работу, активную законотворческую и общественную деятельность
Орден Красной Звезды
Юбилейная медаль «300 лет Российскому флоту»
Медаль «В память 850-летия Москвы»
Юбилейная медаль «60 лет Вооруженных Сил СССР»
Юбилейная медаль «70 лет Вооруженных Сил СССР»
Две медали «За укрепление боевого содружества»
Медаль «За заслуги в увековечении памяти погибших защитников Отечества» (Минобороны России, 2008 год) - за большой личный вклад в увековечение памяти погибших защитников Отечества, установление имен погибших и судеб пропавших без вести военнослужащих, проявленные при этом высокие моральные и деловые качества, усердие и разумную инициативу, оказание содействия в решении задач по увековечению памяти погибших защитников Отечества
Медаль «За безупречную службу» (I, II и III степени)
Почетная грамота Президента Российской Федерации (9 января 2010 года) - за заслуги в законотворческой деятельности и развитии российского парламентаризма
Благодарность Правительства Российской Федерации (17 декабря 2014 года) - за заслуги в законотворческой деятельности и многолетний добросовестный труд
На личных воспоминаниях Ковалева о войне в Афганистане, где ему приходилось вести переговоры с моджахедами, основан художественный фильм режиссера Павла Лунгина «Братство», вышедший в прокат в мае 2019 года. Сам Ковалев стал прототипом главного героя фильма полковника КГБ Николая Дмитриевича, роль которого исполнил Кирилл Пирогов.
Был женат дважды.
От первого брака имел дочь, от второго - сына.