Кристофер Уилдон родился 22 марта 1973 года в городе Йовил, Сомерсет, Англия. Учился балету с 8 лет. Закончил Королевскую балетную школу.
В 1991 году стал лауреатом международного балетного конкурса «Приз Лозанны», выиграв золотую медаль, в том же году был принят в труппу Королевского балета. С 1993 года - в Нью-Йоркском балете, с 1998 - его солист. Первые самостоятельные постановки Уилдона относятся к 1997 году, с 2000 года он выступает уже исключительно как хореограф. Помимо Нью-Йоркского балета, работал с балетными труппами Сан-Франциско, Бостона, Большого театра, лондонского Королевского балета, Национального балета Канады, Гамбургского балета.
В ноябре 2006 года создал собственную балетную труппу «Morphoses/The Wheeldon Company», в 2010 году объявил, что покидает её. В 2012 году был приглашённым хореографом лондонского Королевского балета. Впервые дебютировал в 2018 году, срежиссировав совместно с Россом МакГиббоном мюзикл «Американец в Париже».