Владимир Малыгин родился 19 июня 1950 года. В 1972 году, успешно окончил Московский государственный институт международных отношений Министерства Иностранных Дел СССР, факультет международного права. К дипломатической работе, молодой специалист приступил непосредственно после окончания МГИМО.
В 1989 году, Малыгин получил дополнительное образование, окончив обучение в Дипломатической академии Министерства Иностранных Дел СССР. В период с 1994 по 1996 год, являлся советником-посланником Посольства Российской Федерации в Республике Кипр.
С 2000 года, дипломат занимал должность заместителя директора Департамента - Генерального секретаря Министерства Иностранных Дел России. В 2004 году, занял пост генерального консула Российской Федерации в городе Эдинбург, Великобритания. С 2009 по 2012 год, работал заместителем директора Департамента безопасности МИД России.
В период с 2012 по 2014 год, Владимир Малыгин являлся генеральным консулом России в городе Клайпеда, Литва. С июня 2014 года, замещал должность заместителя директора Второго Европейского департамента, Министерства Иностранных Дел России.
Указом президента Российской Федерации, от 12 декабря 2014 года, Малыгин Владимир Ардалионович, назначен на должность Чрезвычайного и полномочного посла Российской Федерации в Республике Мальта.
В разные периоды общественной и политической деятельности, отмечен государственными наградами и знаками отличия. Является лауреатом различных премий.