Мануэль Нойер родился 27 марта 1986 года, в городе Гельзенкирхен, Северный Рейн-Вестфалия, Федеративная Республика Германия. С 4 лет начал заниматься в футбольной школе клуба «Шальке 04». В 2003 году 16-летний вратарь играл за резервную команду в Региональной лиге, но вылетел вместе с ней в четвертый немецкий дивизион, где и провел целый сезон.
В сезоне 2005-06 призван в первую команду в качестве запасного голкипера, место в основе тогда занимал Франк Рост. В Бундеслиге, тем не менее, Мануэль дебютировал лишь в августе 2006 года в матче с «Алеманией». Игра Нойера понравилась главному тренеру гельзенкирхенцев Мирко Сломке, сделав основным вратарем команды. Всего в сезоне 2006-07 Нойер в составе «Шальке 04» провел 26 матчей.
В марте 2008 года в первом раунде плей-офф против «Порту» вратарь практически в одиночку сражался за «Шальке 04». Нойер отразив несколько опасных ударов по воротам и перевел игру в серию пенальти, где справился с ударами Бруну Алвеша и Лисандро Лопеса, вследствие чего немецкая команда пробилась в 1/4 финала.
В сезоне 2008-09 «Шальке 04» финишировал восьмым и не завоевал путевку в Лигу Европы. Тем не менее, прекрасное выступление Нойера на чемпионате Европы среди молодежи вызвало интерес «Баварии». В ноябре Нойер стал единственным немцем в списке пяти вратарей, претендовавших на место в сборной сезона по версии УЕФА.
Впервые дебютировал за национальную сборную Германии 2 июня 2009 года в товарищеском матче против сборной ОАЭ. На чемпионате мира 2010 года, где немцы стали бронзовыми призерами, Мануэль участвовал во всех встречах команды, кроме игры за третье место. После чемпионата мира стал первым вратарем немецкой сборной.
Нойер стал капитаном «Шальке 04» в сезоне 2010-11 и впервые в истории вывел команду в полуфинал Лиги чемпионов, а также стал обладателем Кубка Германии. В финале «Шальке 04» одержал победу над «Дуйсбургом» со счетом 5:0.
В июне 2011 года «Шальке 04» и «Бавария» подтвердили, что Нойер подписал с клубом из Мюнхена пятилетний контракт. За вратаря заплатили 22 млн евро, став вторым самым дорогим голкипером в истории после итальянца Джанлуиджи Буффона.
На чемпионате Европы 2012 вызван в сборную, первые матчи отыграл уверенно и надежно, в матче с Грецией пропустил 2 гола. В полуфинальном матче с Италией также пропустил 2 мяча от. На чемпионате мира 2014 года, помимо общекомандной победы в турнире, также получил золотую перчатку лучшего вратаря.
На Евро-2016, Нойер сыграл 6 матчей и пропустил 3 мяча, 2 из них с пенальти. В полуфинальном матче с хозяевами чемпионата Францией, Мануэль вновь пропустил 2 гола от одного же игрока, на этот раз от Антуана Гризманна. В июле 2016 года, после ухода Бастиана Швайнштайгера, стал капитаном сборной Германии.
Тренерский штаб национальной сборной Германии во главе с Йохимом Левом 4 июня 2018 года включил Мануэля Нойера в состав команды на Чемпионат мира по футболу в России 2018 года.
Командные достижения:
ФК «Шальке 04»:
Обладатель Кубка немецкой лиги: 2005.
Обладатель Кубка Германии: 2010-11.
ФК «Бавария»:
Чемпион Бундеслиги: 2012-13, 2013-14, 2014-15, 2015-16, 2016-17, 2017-18.
Обладатель Кубка Германии: 2012-13, 2013-14, 2015-16.
Обладатель Суперкубка Германии: 2012, 2016.
Победитель Лиги чемпионов УЕФА: 2012-13.
Обладатель Суперкубка УЕФА: 2013.
Победитель Клубного чемпионата мира: 2013.
Сборная Германии:
- Чемпион мира: 2014.
- Бронзовый призер чемпионата мира: 2010.
- Бронзовый призер чемпионата Европы: 2012, 2016.
Личные:
- Лучший вратарь Бундеслиги: 2007.
- Лучший вратарь молодежного чемпионата Европы: 2009.
- Премия Silbernes Lorbeerblatt: 2010.
- Футболист года в Германии: 2011, 2014.
- Символическая сборная чемпионата Европы 2012.
- Вратарь года по версии ESM: 2012.
- Лучший вратарь года по версии IFFHS: 2013, 2014, 2015.
- Лучший вратарь чемпионата мира по версии ФИФА: 2014.
- Символическая сборная года по версии Goal.com: 2014.