Марк Ротемунд родился 26 августа 1968 года в Германии. Отец Марка - известный немецкий режиссер Зиги Ротемунд, брат актрисы Нины Ротемунд. Свою карьеру Марк начал в качестве помощника режиссера у своего отца и других немецкий режиссеров.

Профессиональным дебютом Марка стал фильм под названием «Странное поведение половозрелых горожан во время брачного сезона». Фильм рассказывает о том, как писатель Чарли переживает очередной провал своей новой книги, катаясь на «Феррари» своего издателя. Его бывшая жена Мануэла пытается избавиться от назойливого преследования Свена, который, как ей кажется, пытается похитить ее дочь.

У Чарли угоняют «Феррари» две случайно встретившиеся в торговом центре женщины: Корнелия и Хильде. Сын первой из них, не подозревая о приключениях своей матери, в этот момент готовится к свиданию, но не знает как признаться девушке в своих чувствах. Кажется, что все эти и другие сюжетные линии в фильме развиваются совершенно независимо друг от друга, однако всем им суждено пересечься самым непостижимым образом. За эту картину режиссер получил премию «Bayerischer Filmpreis» как «Лучший начинающий режиссер».

В 2000 году Ротемунд снял комедийный фильм о половом созревании подростков под названием «Муравьи в штанах». Главный герой фильма - подросток Флориан. Он влюбляется в красивую девушку Леони, и теперь куда бы Фло не посмотрел, везде он видит Леони. А она не обращает на Фло никакого внимания. В финале фильма спектакль «Ромео и Джульетта», в котором Фло играет Ромео, а Джульетту - Лиза. Но, в конце концов, Флориан понимает, что Леони ему не нужна, а он любит маленькую неприметную Лизу.

В 2005 году в прокат вышла картина «Последние дни Софии Шолль», в которой Марк выпустил в качестве режиссера. Фильм рассказывает о судьбе мюнхенской студентки-антифашистки, которая была казнена по приговору нацисткого суда. Действие картины происходит в феврале 1943 года. Фильм получил положительные отзывы со стороны кинокритиков и был номинирован на премию «Оскар» как «Лучший фильм на иностранном языке». Также фильм стал победителем «Европейской киноакадемии» и «Берлинского кинофестиваля».Позже режиссер выпустил фильмы «Сексуальная революция», «Фанатки на завтрак не остаются», «Что творят немецкие мужчины» и «Сегодня я блондинка».

В 2017 году на экраны выйдет фильм Марка Ротемунда «Несмотря ни на что». Салия, в иполнении Кости Улльмана,- многообещающий студент, который почти полностью потерял зрение, еще будучи подростком. Несмотря ни на что, герой считает, что слепота не должна как-то ограничивать его жизнь и стремления. А потому решает воплотить свою мечту и устроиться на работу в роскошный отель. Скрывая от работодателей и коллег свой недуг, он добивается места в самом престижном заведении Мюнхена.