Герман Капалин родился 7 августа 1949 года в поселке Удельная, Московская область. По окончании средней школы, учился в Московском машиностроительном техникуме. В 1970 году, поступил во 2 класс Московской духовной семинарии и отправился проходить срочную службу в ВС СССР.
В ноябре 1972 года, Капалин уволился в запас и продолжил обучение в семинарии, по окончании которой, в 1974 году, поступил в Московскую духовную академию.
С 1977 года, принимал активное участие в работе Всемирной православной молодежной организации «Синдесмос» и экуменическом Совете молодежи Европы - ЭСМЕ.
В 1978 году, окончил Московскую духовную академию со степенью кандидата богословия, и назначен на должность помощника инспектора и преподавателя сектора заочного обучения ВУЗа.
Инспектором МДА архимандритом Александром, 7 декабря 1978 года, Герман Капалин пострижен в монашество с наречением именем Климент в честь священномученика Климента, епископа Римского. Рукоположен во иеродиакона 24 декабря того же года, архиепископом Дмитровским Владимиром.
Служитель церкви Климент 7 апреля 1979 года рукоположен во иеромонаха. В том же году назначен преподавателем Общей церковной истории в Московской Духовной Семинарии. В сан игумена возведен 14 октября 1981 года.
Начиная с 1981 года, священнослужитель исполнял обязанности старшего помощника инспектора МДС. В то же время, вошел в состав исполкома ЭСМЕ.
В сан архимандрита возведен 18 июля 1982 года, а 8 августа того же года, в Свято-Духовском соборе города Минск, Климент хиротонисан во епископа Серпуховского, викария Московской епархии и назначен управляющим Патриаршими приходами в Канаде и временно в США. Хиротонию совершили: митрополит Минский и Белорусский Филарет, архиепископ Харьковский и Богодуховский Никодим, епископ Тульский и Белевский Герман, епископ Пинский Афанасий.
С 23 марта 1987 года, освобожден от управления Патриаршими приходами в Канаде и назначен управляющим Патриаршими приходами в США.
Указом Святейшего Патриарха Пимена от 19 мая 1989 года, православный священник возведен в сан архиепископа. С 20 июля 1990 года, являлся архиепископом Калужский и Боровский и одновременно первым заместителем председателя Отдела внешних церковных связей.
С 1993 по 1996 год, входил в состав Общественной палаты при Президенте РФ.
Представлял Русскую Православную Церковь в межправославной комиссии по подготовке общеправославного празднования 2000-летия Рождества Христова в период с 1997 по 2000 год. Возглавлял секретариат по подготовке и проведению мероприятия.
С 26 декабря 2003 года, руководил делами Московской Патриархии и исполнял полномочия постоянного члена Священного Синода.
В сан митрополита возведен 25 февраля 2004 года.
С октября 2005 года, вновь входил в состав Общественной палаты Российской Федерации.
В январе 2006 года, назначен председателем Комиссии по сохранению духовного и культурного наследия Общественной палаты Российской Федерации.
Определением Священного Синода от 31 марта 2009 года, освобожден от обязанностей управляющего делами Московской Патриархии и назначен председателем Издательского Совета Русской Православной Церкви.
С 22 марта 2011 года, является членом Высшего Церковного Совета РПЦ.
Решением Священного Синода от 29 мая 2013 года, назначен на должность ректора Калужской духовной семинарии и утвержден на посту настоятеля - священноархимандрита Рождества Пресвятой Богородицы Пафнутьева Боровского мужского монастыря города Боровска Калужской области и мужской Успения Пресвятой Богородицы Калужской Тихоновой пустыни села Льва Толстого Дзержинского района Калужской области.
На должность главы новообразованной Калужской митрополии, Климент назначен решением Священного Синода от 2 октября 2013 года.
С октября 2013 по май 2014 года, временно управлял Песоченской епархией.
Защитил диссертацию на соискание ученой степени доктора исторических наук по теме «Русская Православная Церковь и освоение Тихоокеанского севера в XVIII-XIX веке по материалам Аляски» в Российской академии народного хозяйства и государственной службы при Президенте РФ.
Указом Президента Российской Федерации от 29 апреля 2019 года, «за большой вклад в развитие духовной культуры, укрепление межнационального и межконфессионального мира и согласия в обществе» Капалин Герман Михайлович удостоен Ордена «За заслуги перед Отечеством» III степени. Награждение состоялось 21 ноября 2019 года в Кремле.
Общественная деятельность Митрополита Климента
С 15 октября 2018 года - Председатель комиссии Межсоборного присутствия по вопросам общественной жизни, культуры, науки и информации.
Председатель оргкомитета Международных образовательных Рождественских чтений.
Возглавлял оргкомитет по подготовке и проведению Церковно-общественного форума «Духовно-нравственные основы демографического развития России» (октябрь 2004 г.)
Возглавлял оргкомитет по подготовке и проведению I фестиваля православных СМИ «Вера и слово» (ноябрь 2004 г.) и празднования 625-летия Куликовской битвы (май-ноябрь 2005 г.)
Научные работы и публикации Митрополита Климента
Духовный облик и поведение пастыря (кандидатская диссертация).
Архиепископ Калужский и Боровский Климент. В стране святых воспоминаний. Издательство Калужской духовной семинарии. 2004.
Речь при наречении во епископа Серпуховского. // ЖМП. 1982. № 10. С. 6; Братья Киреевские - путь христианского становления. // Иван и Петр Киреевские в русской культуре. Издательство Гриф. Калуга. 2001. С. 5-10.
Миссионерское служение Русской Православной Церкви на Аляске. // Богословско-исторический сборник. Издательство Калужской духовной семинарии. № 1. 2003. С. 35-78.
Святитель Иннокентий и рассвет православной миссии на Аляске. // Богословско-исторический сборник. Издательство Калужской духовной семинарии. № 2. 2004. С. 35-126.
Православная семья в становлении Российского государства. // Седьмые образовательные Богородично-Рождественские чтения. Сборник докладов. Обнинск. 2004. С. 5-9.
Мировоззрение и образ жизни современной молодежи. // Шестые образовательные Богородично-Рождественские чтения. Сборник докладов. Обнинск. 2004. С. 9-19.
Задачи православных СМИ и нравственная ответственность журналиста. // Материалы Первого международного фестиваля православных СМИ 16-18 ноября 2004 г. Издательский Совет Русской Православной Церкви. Москва. 2005. С. 37-49.
Благополучие общества состоит в твердости веры, в духовном, нравственном росте. // Духовно-нравственные основы демографического развития России (материалы церковно-общественного форума) 18-19 октября 2004 г. Москва. 2005. С. 11-18.
Русская Православная Церковь на Аляске до 1917 года. 2009. Монография.
Русская Православная Церковь и освоение Тихоокеанского севера в XVIII-XIX вв. (по материалам Аляски) (докторская диссертация).
Многочисленные публикации в центральной и местной печати - как церковной, так и светской.
Церковные:
1986 г. - орден прп. Сергия Радонежского II ст.;
1989 г. - орден прп. Германа Аляскинского (Православная Церковь в Америке);
1996 г. - орден св. блгв. кн. Даниила Московского II ст.;
1997 г. - орден Святогробского братства I ст. (Иерусалимская Православная Церковь);
1998 г. - орден св. Климента Охридского I ст. (Болгарская Православная Церковь);
1999 г. - орден свт. Иннокентия Московского II ст.;
2000 г. - орден ап. Марка I ст. (Александрийская Православная Церковь);
2000 г. - орден мч. Трифона II ст.;
2004 г. - орден св. равноап. кн. Владимира II ст.;
2007 г. - орден прп. Серафима Саровского II ст.;
2009 г. - орден свт. Алексия Московского II ст.;
2017 г. ― медаль «За жертвенные труды» (Ижевская епархия);
2018 г. ― медаль «25 лет Кемеровской епархии»;
2019 г. - орден св. блгв. кн. Даниила Московского III ст.;
2019 г. - орден священноисповедника Николая Алма-Атинского (Митрополичий округ в Республике Казахстан);
2019 г. - Патриаршая грамота;
2019 г. - медаль «За усердные труды на ниве духовного просвещения» I ст. (Учебный комитет Русской Православной Церкви).
Светские:
1997 г. - медаль 850-летия Москвы;
1988 г. - орден Дружбы народов;
2000 г. - орден Почета;
2001, 2003 гг. - национальная премия Русского биографического института по номинации «Человек года»;
2014 г. - национальная премия «Лучшие книги и издательства года - 2013» за развитие книгоиздательского дела;
2016 г. - медаль «120 лет со дня рождения Г.К. Жукова»;
2018 г. - орден им. министра внутренних дел Российской империи В.К. Плеве;
2019 г. - орден «За заслуги перед Отечеством» III ст.;
2019 г. - почетный памятный знак «Орден Вифлиемская звезда» (ИППО);
2019 г. - орден Российского книжного союза;
2019 г. - почетный знак губернатора Калужской области «За личный вклад в развитие Калужской области».