Ия Нинидзе родилась 8 сентября 1960 года в городе Тбилиси, Грузия. Мать была филологом, преподавателем русского языка и литературы, отец - режиссером телевидения.
Родители были в разводе и девочка жила с мамой, тетей, бабушкой и дедушкой. С шести лет Ия занималась в балетном кружке Тбилисского дома пионеров, затем училась в Тбилисском хореографическом училище. В 8 лет она получила приглашение от режиссера Георгия Данелия на эпизодическую роль в фильме «Не горюй», потом были роли в фильмах «Мелодии Верийского квартала», «Первая ласточка», но прославилась Ия Нинидзе, сыграв роль Денизы в мюзикле Леонида Квинихидзе «Небесные ласточки».
В 1981 году Ия Нинидзе окончила ВГИК, мастерскую Сергея Бондарчука и Ирины Скобцевой, и с 1981 по 1996 год служила в Государственном академическом театре имени Шота Руставели; играла в спектаклях Роберта Стуруа «Кровавая свадьба», «Рождественская ночь» и других.
В 1997 году актриса переехала в Москву, была актрисой Московского Театра кабаре «Летучая мышь» под руководством Григория Гурвича. После травмы, полученной на репетиции спектакля «Великая иллюзия», на несколько лет ушла из театра и сделала собственную концертную программу.
Ия Нинидзе снялась более чем в двадцати фильмах, в том числе: «Слезы капали», «Приказано взять живым», «Покаяние», «Любимец публики», «Операция "Вундерланд"», «Яков, сын Сталина», в сериалах «Простые истины», «Марш Турецкого», «Нина», «Сыщик без лицензии», в фильмах «Прощальное эхо», «Золушка.ру», «Охота на Берию», «Васильевский остров» и другие.
Является Заслуженной артисткой и народной артисткой Грузинской АССР.
В настоящее время выступает с сольной программой, участвует в телепрограммах, конкурсах, фестивалях, снимается в кинофильмах и сериалах.