Президент «Союза работодателей ракетно-космической промышленности России».
Действительный государственный советник РФ третьего класса.
Сергей Пономарев родился 12 мая 1954 года в городе Вологда. В 1976 году окончил Серпуховский военный институт ракетных войск по специальности «Эксплуатация приборов и систем управления летательных аппаратов». В 1987 году окончил Военную академию ракетных войск стратегического назначения имени Петра Великого по специальности «Офицер по управлению боевыми действиями».
С 1976 года по 2006 год Сергей Пономарев проходил службу на различных должностях в Ракетных войсках стратегического назначения. Ушел в отставку в звании Генерал-лейтенант. Кандидат технических наук. Автор ряда научных статей.
С августа 2006 года Сергей Алексеевич работал в Федеральном космическом агентстве начальником Сводного управления организации космической деятельности. С февраля 2008 года - заместитель руководителя Федерального космического агентства.
Указом Президента РФ от 25 января 2009 года Пономареву присвоен классный чин государственной гражданской службы действительного государственного советника РФ 3 класса. С 2015 года Сергей Алексеевич заместитель генерального директора по боевой ракетной технике государственной корпорации «Роскосмос», а с марта 2107 года занимает пост советника генерального директора «Роскосмос».
С декабря 2017 года - президент Общероссийского отраслевого объединения работодателей «Союз работодателей ракетно-космической промышленности России».
Орден «Красной Звезды»
Орден «За военные заслуги»
Орден «За заслуги перед Отечеством» IV степени
Лауреат премии Правительства РФ