Андрей Прокопенко родился 14 июня 1983 года в городе Харьков, Украина. В 2005 году, окончил Академию гражданской защиты МЧС России. Позднее, получил дополнительное образование, завершив курс обучения на факультете руководящего состава вышеуказанного ВУЗа.
С ноября 2010 по март 2011 года, Прокопенко проходил службу в должности заместителя начальника отдела аварийно-спасательных работ, управления аварийно-спасательных работ, 1169 центра по проведению аварийно-спасательных работ, 179 спасательного центра города Ногинск.
Далее, с марта 2011 года, являлся старшим помощником начальника отдела оперативного реагирования 179 спасательного центра, а в ноябре 2012 года, перешел на должность заместителя начальника цикла - преподавателя цикла подготовки специалистов, 40-го Российского центра подготовки спасателей 179 спасательного центра МЧС России.
Позже, с августа 2016 года, служил в качестве начальника отдела оперативного планирования Главного Управления МЧС Российской Федерации по Хабаровскому краю.
На протяжении 2017 года, замещал должность заместителя начальника отдела экстренного реагирования и планирования управления организации взаимодействия, применения сил и инспектирования. Так же, возглавлял отдел гражданской обороны и предупреждения чрезвычайных ситуаций управления гражданской защиты ГУ МЧС РФ по Хабаровскому краю.
Впоследствии, 19 октября 2018 года, Прокопенко Андрей Игоревич назначен на должность заместителя начальника Главного управления МЧС России по Хабаровскому краю по защите, мониторингу и предупреждению ЧС - начальником управления гражданской защиты.
Отмечен государственными наградами и знаками отличия.