Член Президиума Российской академии наук.

Валерий Рубаков родился 16 февраля 1955 года в городе Москва. Высшее образование получил в 1978 году, окончив физический факультет Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова. Позднее защитил диссертацию на соискание ученой степени доктора физико-математических наук.

С 1987 по 1994 года занимал должность заместителя Директора Института ядерных исследований Российской академии наук по научной работе. Впоследствии стал Главным научным сотрудником ИЯИ РАН, заведующим кафедрой физики частиц и космологии физического факультета МГУ.

В 1990 году Рубакова избрали членом-корреспондентом РАН, позднее назначили Академиком РАН по Отделению физических наук. Входит в состав Президиума. Заместитель председателя Комиссии РАН по борьбе с лженаукой и фальсификацией научных исследований. Специалист в области физики элементарных частиц, квантовой теории поля и космологии.

Большой цикл работ за период с 1990 по 2000 года посвящен изучению непертурбативных, инстантонных вкладов в сечение рассеяния частиц высоких энергий. Ранее Рубаков и М.Е. Шапошников предложили концепцию многомерного мира, включающую в себя дополнительные бесконечные пространственные измерения, наблюдение которых возможно при высоких энергиях. После построения моделей с локализованной на трехмерном многообразии гравитацией, концепция многомерного мира получила бурное развитие.

Валерий Анатольевич является одним из организаторов регулярных Международных конференций «Кварки» и международных школ «Частицы и космология». Автор более 160 научных работ. Первый заместитель главного редактора журнала «Успехи физических наук».

Рубаков награжден золотой медалью с премией для молодых ученых Академии наук. Лауреат многих премий, в том числе: Президиума РАН имени А.А. Фридмана; Международной премии Института теоретической и экспериментальной физики имени И.Я. Померанчука; имени академика М.А. Маркова; академика Б. Понтекорво.  Удостоен премий имени Ю. Весса и М.В. Ломоносова.