Андрей Рубанов родился 25 июля 1969 года в селе Узуново, Московской области. В период с 1987 по 1989 год проходил срочную службу в вооруженных силах РФ, в частях Противовоздушной Обороны. Учился на факультете журналистики Московского Государственного Университета. В молодости Андрей работал на различных должностях: корреспондентом многотиражной газеты, строительным рабочим, шофером, телохранителем. Занимался предпринимательством.
В период с 1999 по 2000 год жил в Чеченской Республике. Работал на должности пресс-секретаря первого заместителя полномочного представителя Правительства Российской Федерации в Чеченской республике. В 2001 году Рубанов, вернувшись в Москву возобновил предпринимательскую деятельность.
В 2005 году, Андрей Рубанов выпустил дебютную книгу - «Сажайте, и вырастет». Во многом, роман являлся автобиографическим, о жизни нелегального банкира в «лихие» девяностые. Книга была издана за счет автора. В 2006 году роман попал в короткий список премии «Национальный бестселлер». Неоднократно переиздан и переведен на английский язык под названием «Do Time Get Time». Следом вышли романы Великая мечта, Жизнь удалась, Готовься к войне. В 2009 году издана книга Хлорофилия .
Книги Андрея Рубанова переведены на английский, французский, немецкий, испанский, итальянский, сербский и болгарский языки. Рассказы, статьи и очерки печатались в журналах «Наш современник», «Звезда», «Афиша», «Эсквайр», «Сноб», «Нация». Наибольшую известность получил как автор книг в жанре автобиографической прозы, или «нового реализма». Также выпустил несколько фантастических романов в жанре «биопанк».
Рубанов является финалистом международной премии имени Аркадия и Бориса Стругацких за романы «Хлорофилия» и «Живая земля». Участник шорт-листа литературной премии «Большая книга». Четырехкратный полуфиналист литературной премии «Национальный бестселлер».
Ежегодную общероссийскую литературную премию «Национальный бестселлер» получил Андрей Рубанов и его книга «Финист - ясный сокол». Церемония награждения прошла 25 мая 2019 года на Новой сцене Александринского театра в Санкт-Петербурге.
Женат, имеет сына 1995 года рождения. Живет и работает в городе Москва.