Сергей Рудаков родился 23 апреля 1958 года в городе Первоуральск, Свердловская область. Трудовую деятельность начал рабочим Свердловского приборо-строительного завода. С 1976 по 1978 год, проходил срочную службу в Вооруженных Силах СССР. После увольнения в запас, вернулся на работу на Свердловский ПСЗ.
В 1983 году, Рудаков окончил Свердловский юридический институт и поступил на стажировку в Ленинский районный суд города. Начиная с октября того же года, работал народным судьей Березовского городского народного суда отдела юстиции Свердловского облисполкома.
С 1987 года, являлся судьей Свердловского областного суда.
В 1994 году, Сергей Валентинович занял пост судьи Верховного Суда Российской Федерации.
С 2014 года, служил заместителем Председателя Верховного Суда Российской Федерации - председателем Дисциплинарной коллегии Верховного Суда Российской Федерации.
В соответствии с Постановлением Совета Федерации Федерального Собрания Российской Федерации от 11 декабря 2019 года, Рудаков Сергей Валентинович вновь утвержден в должности заместителя Председателя Верховного Суда Российской Федерации - председателя Дисциплинарной коллегии Верховного Суда Российской Федерации.