Владимир Шарпатов родился 21 марта 1940 года в поселке Красногорский Звениговского района Марийской республики. После школы поступал в лётное училище, но не прошел. Работал столяром, шофером, поступил в Казанский авиационный институт на дневное отделение. Занимался в аэроклубе, стал планеристом. После окончания третьего курса института поступил в Краснокутское летное училище гражданской авиации.
В 1965 году окончил училище и по распределению был направлен в Тюмень, где работал много лет, в том числе и на международных маршрутах. В 1971 году поступил в Университет гражданской авиации. В 1976 году закончил по специальности инженер-пилот.
Самолёт Ил-76, принадлежащий компании «Аэростан» 3 августа 1995 года был принудительно посажен на аэродром вблизи города Кандагар в Афганистане. Командиром воздушного судна был Владимир Шарпатов. Экипаж самолёта попал в плен. Спустя год и 13 дней, 16 августа 1996 года экипаж самолёта смог совершить побег из плена угнав свой же самолет.
Звание Героя России Владимиру Шарпатову присвоено указом президента от 22 августа 1996 года. Звезду Героя России пилоту вручил в Кремле премьер-министр Черномырдин.
После возвращения из плена Владимир Ильич некоторое время продолжал работать в компании «Аэростан», но 1 декабря 1998 года в возрасте 58 лет был уволен «по сокращению штатов». Безуспешно пробовал добиться восстановления на работе, даже через суд.
После чего уехал в город Тюмень, где по распоряжению губернатора Тюмени Герою России выделили большую квартиру в центре города. Лётчик вновь сел за штурвал Ил-76 авиакомпании «Тюменьавиа». В частности, летал в Турцию, Эмираты. В возрасте 62-х лет ушёл с летной работы.
Избран депутатом Тюменской областной Думы пятого созыва 8 декабря 2011 года по единому избирательному округу от "Регионального отделения Политической партии Справедливая Россия в Тюменской области" .