Василий Шушаков родился 6 сентября 1975 года в селе Дмитрово-Титово, Алтайский край. В 1996 году окончил Омскую высшую школу милиции Министерства Внутренних Дел Российской Федерации, с присвоением квалификации «юрист». После получения диплома, молодой человек получил направление для прохождения дальнейшей службы в подразделение уголовного розыска Управления Внутренних Дел Советского района города Омск.
Позднее, в 2004 году, Василий Сергеевич назначен первым заместителем начальника линейного ОВД на станции «Омск» Западно-Сибирского Управления Внутренних Дел на транспорте Министерства Внутренних Дел России - начальником криминальной милиции.
В 2005 году, перешел на пост начальника УВД по Центральному району города Новосибирск. С 2009 года, офицер служил в качестве заместителя начальника Управления Внутренних Дел по городу Новосибирск - начальником штаба. Затем, в 2011 году приступил к исполнению обязанностей заместителя начальника полиции ГУ МВД России по Новосибирской области.
В октябре 2016 года, Шушаков Василий Сергеевич назначен на должность начальника Управления Федеральной службы войск национальной гвардии РФ по Новосибирской области.
Генерал-майор полиции. Отмечен государственными наградами и знаками отличия, в числе которых медаль «За отличие в охране общественного порядка» и медаль ордена «За заслуги перед Отечеством» II степени.