Эдуард Скоробогатов родился 5 апреля 1973 года в городе Челябинск. В 1995 году окончил Тюменский государственный нефтегазовый университет по специальности «экономика и управление на предприятиях топливно-энергетического комплекса». Позднее, получил дополнительное образование, успешно завершив курс обучения в Академии народного хозяйства при Правительстве Российской Федерации.
Трудовую деятельность начал непосредственно по окончании университета, в качестве экономиста нефтегазодобывающего управления «Сургутнефть» АООТ «Сургутнефтегаз».
С 1996 по 1998 год, замещал должности ведущего инженера и начальника отдела организации труда и заработной платы нефтегазодобывающего управления «Быстринскнефть» Открытого Акционерного Общества «Сургутнефтегаз».
В 1998 году, назначен ведущим инженером Отдела организации труда и заработной платы Общества с Ограниченной Ответственностью «Сургутгазпром».
С 2000 по 2001 год, Скоробогатов работал начальником лаборатории по нормированию труда Сургутского завода по стабилизации конденсата ООО «Сургутгазпром».
Начиная с 2001 года, опытный управленец возглавлял отдел управления персоналом ООО «Сургутгазпром», затем ООО «Газпром трансгаз Сургут».
С 2009 по 2014 год, находился на посту Председателя Объединенной профсоюзной организации ООО «Газпром трансгаз Сургут».
В 2014 году, Скоробогатов Эдуард Евгеньевич назначен на должность заместителя генерального директора по управлению персоналом Общества с Ограниченной Ответственностью «Газпром трансгаз Сургут» Публичного Акционерного Общества «Газпром».