Джон Маркус МакНэйри родился 11 ноября 1977 года в городе Даллас, штат Техас, США. Много времени проводил на ранчо своих родителей. Позже поменял свое имя на Скут, в детстве отец называл его Scooter. Карьеру МакНэйри начал в 2000-х годах с эпизодических ролей необычных характерных парней в сериалах. Начиная с 2005 года, снялся в небольших ролях в картинах «Сумасшедшие гонки», «Реклама для гения» и других.

В 2007 году Скут спродюсировал и снялся в главной роли в фильме «Полночный поцелуй», который, по мнению некоторых кинокритиков, вывел актера на новый уровень. Фильм рассказывает историю Уилсона, 29-летнего парня, пережившего самый худший год своей жизни. Он впервые оказывается в Лос-Анджелесе - без подруги, без конкретных планов, но с твердым намерением «запереть все двери» и навсегда забыть прошлый год, словно его никогда и не было.

В 2010 году в прокат вышел фантастический фильм режиссёра Гарета Эдвардса «Монстры». В фильме всего два актера. Остальные роли исполнили люди, случайно оказавшиеся на месте съёмок. Уитни Эйбл и Скут МакНэйри были выбраны режиссёром Гаретом Эдвардсом не случайно: ему было важно, чтобы между актерами в реальной жизни существовали чувства, которые могли быть заметны на экране.

Увидев Уитни и Скута, которые в то время встречались, Эдвардс, поговорив с ними несколько минут, сказал: «Да, это они!». Фильм стал одним из фаворитов Международного Каннского кинофестиваля. Вскоре после премьеры ленты «Монстры» Уитни Эйбл и Скут МакНэйри стали мужем и женой.

В 2011 году МакНэйри сыграл одну из главных ролей в фильме «Ограбление казино», после этого в 2012 году был приглашен Беном Аффлеком к съемкам в фильме «Операция «Арго» и Гасом Ван Сентом в фильм «Страна обетованная». Также в 2012 году принял участие в съемках картины «Двенадцать лет рабства» Стива Маккуина.