Тоби Магуайр родился 27 июня 1975 года в городе Санта-Моника, штат Калифорния, США. Его родители были очень молоды, отец работал поваром и строителем, мать - секретарем. Они развелись, когда сыну было два года.
Дебют Тоби в кино состоялся в 1979 году, в эпизоде сериала General Hospital, но в юности он хотел стать поваром, как отец. В 13 лет он бросил школу, и пошел работать - сниматься в рекламных роликах. Затем Тоби снялся в нескольких сериалах.
И в 1993 году он сыграл в «настоящем кино» - фильме «Правдивая история этого парня», где главные роли играли Роберт де Ниро и Эллен Баркин. После этого Магуайр стал сниматься очень часто, среди его наиболее заметных работ в кино - роли в картинах: «Ледяной ветер», «Страх и ненависть в Лас-Вегасе», «Плезантвиль», «Правила виноделов», «Вундеркинды» и других.
Ряд фильмов с его участием были номинированы на Оскар. Тоби стал популярным, но настоящая всемирная слава пришла к нему после съемок в знаменитой трилогии о Человеке-пауке, первая часть которой вышла в 2002 году. Он сыграл в нем роль супергероя Человека-паука и его второе «я» - Питера Паркера.
В 2004 году вышел фильм «Человек-паук 2», который стал ещё более удачным и с коммерческой точки зрения, и по оценкам критиков.
В 2007 году - третий фильм «Человек-паук 3».
В последующие годы актер снялся еще в нескольких картинах - «Солдаты неудачи», «Братья», «Детали», «Великий Гэтсби» и других.
В апреле 2006 года Магуайр женился на Дженнифер Мейер, дизайнере ювелирных украшений и дочери продюсера киностудии Universal Studios Рона Мейера. В этом браке родились двое детей - дочь и сын.
Тоби Магуайр - обладатель премий Академии научной фантастики, фэнтези и фильмов ужасов, Общества кинокритиков Торонто, кинопремии MTV, двух премий «Сатурн» и других. Сегодня он продолжает свою кинематографическую карьеру.