Баяр Цыденов родился 1 сентября 1970 года в селе Санага Закаменского района Республики Бурятия. C 1987 по 1990 год учился в Читинском медицинском институте на стоматологическом факультете. Затем год обучался в Санкт-Петербургском буддийском дацане Гунзэчойнэй. В период с 1991 по 1993 год получил образование в Буддийской Духовной семинарии в Гамбурге. Имеет диплом семинарии.
В 1994 году Цыденов назначен настоятелем Санагинского дацана Даша Пунцоглин. В 2008 году избран депутатом IV созыва Совета депутатов муниципального образования «Закаменский район». С 2013 года является депутатом Народного Хурала Республики Бурятия. Входит в состав Комитета по межрегиональным связям, национальным вопросам, молодёжной политике, общественным и религиозным объединениям Республики Бурятия.
Баяр Бимбаевич является членом межпарламентской комиссии для координации мероприятий по сотрудничеству между Народным Хуралом Республики Бурятия Российской Федерации и Великим Государственным Хуралом Монголии. Неоднократно принимал активное участие в буддийских саммитах в Индии, Японии, Южной Корее, Сирии, Монголии и других странах.