Российский военнослужащий. Служил в 17-м отряде специального назначения внутренних войск. 

Сергей Цыганенко родился 14 июля 1973 года в городе Нальчик, Кабардино-Балкарская Республика. После окончания школы проходил срочную службу на Балтийском флоте. Затем подписал контракт на продолжение военной службы в группе спецназа в местном полку оперативного назначения внутренних войск.

Во время Первой Чеченской войны в районе поселка Рошни-Чу спецназовцы из Нальчика выбивали с безымянной высотки группу боевиков. Нескольких бандитов удалось уничтожить, остальные укрылись. Цыганенко обнаружил снайпера, который находился в укрытии под упавшим деревом. После продолжительного противостояния спецназовцу удалось уничтожить боевика. 

В 1998 году Сергей попал в 17-й отряд специального назначения и вместе с ним отравился охранять административную границу Ставропольского края с Чеченской республикой. В 1999 году отряд получил задачу освободить от бандитов населенный пункт Чабанмахи. Цыганенко являлся заместителем командира группы. После ранения командира остался командовать группой. затем принимал участие в боях в Кадарской зоне. Осенью его перебросили на север Чечни.

В составе созданной там группировки войск спецназовцам предстояло штурмовать Грозный. Во время боев прапорщик Сергей Цыганенко получил ранение. Его отправили в госпиталь в качестве сопровождающего в Моздок для группы дембелей, у которых закончилось время службы по призыву. После выздоровления вернулся в Чечню.

В начале 2002 года Цыганенко во время полугодового отпуска поступил на курсы подготовки младших офицеров в Северо-Кавказский военный институт внутренних войск. Посещал занятия в секции альпинизма. В августе в составе команды института участвовал в восхождении на Эльбрус. В октябре получил диплом об окончании курсов и погоны младшего лейтенанта. 

Затем младший лейтенант отправился в очередную командировку в Чечню. В качестве старшего офицера для автоколонны 22 ноября 2002 года Сергей отправился в Ханкалу. Когда до места расположения отряда оставалось минут десять езды, по машине открыли огонь из автоматов. В результате обстрела Цыганенко получил смертельное ранение. Похоронен в небольшом городке под Нальчиком. Награжден Орденом Мужества посмертно.