Антон Ушаков родился 16 мая 1972 года в городе Глазов, Удмуртская Республика. После школы поступил профессионально-техническое училище. Работал электромонтером на городском узле связи в городе Глазов. В период с 1990 по 1992 год Антон проходил срочную службу в Вооружённых Силах в Воздушно-десантных войсках. Принимал участие в боевых действиях в период межнационального вооруженного конфликта в Нагорном Карабахе.
После увольнения в запас, Ушаков Антон вернулся в город Глазов, где работал по специальности. В 1994 году поступил на службу по контракту в 3-ю гвардейскую Отдельную бригаду специального назначения Главного разведывательного управления Генерального Штаба, которая дислоцировалась в поселке Рощинский, Самарской области и входила в состав Приволжского военного округа.
Службу в бригаде начал на должности командира отделения, затем стал старшиной роты. С 1 марта 1995 года, в составе бригады, Антон Ушаков принимал непосредственное участие в боевых действиях на территории Чеченской Республики. Исполнял обязанности заместителя командира группы.
В бою с бандформированиями, 21 марта 1995 года в районе города Аргун Чеченской республики закрыл своим телом командира от вражеского огня. Погиб смертью храбрых.
За мужество и героизм, проявленные при выполнении специального задания Указом Президента Российской Федерации от 29 января 1997 года гвардии старшине Ушакову Антону Борисовичу присвоено звание Героя Российской Федерации (посмертно).
Антон Ушаков похоронен в городе Глазов. В память о Герое на родине установлена мемориальная доска. Герою России Антону Ушакову и ещё троим воинам, погибшим в Чеченской республике, установлен памятник на территории 3-й гвардейской бригады спецназа ГРУ.