Сергей Васильев родился 17 сентября 1966 года в Орловской области. В 1995 году окончил Академию Федеральной службы безопасности России по специальности «Юриспруденция». Имеет ученую степень кандидата юридических наук.
В возрасте двадцати трех лет поступил на службу в органы Федеральной службы безопасности Российской Федерации. С 1989 года по 2011 год занимал различные должности в ФСБ.
С 2011 года Сергей Васильев являлся заместителем начальника управления организации избирательного процесса. Затем находился в должности заместителя начальника управления по взаимодействию с политическими партиями, общественными организациями и органами государственной власти - начальника отдела аппарата Центральной избирательной комиссии РФ.
В 2016 году возглавил управление Федеральной службы по надзору в сфере природопользования по Волгоградской области.
Распоряжением губернатора Астраханской области Игоря Бабушкина 18 декабря 2019 года Васильев Сергей Васильевич назначен на должность руководителя администрации губернатора Астраханской области.
Имеет классный чин Действительный государственный советник РФ III класса.
Женат, воспитывает сына и дочь.
Грамота ФСБ России
Почетная грамота Центральной избирательной комиссии Российской Федерации
Благодарность Президента Российской Федерации
Медаль ордена «За заслуги перед Отечеством» II степени
Благодарственное письмо Президента Российской Федерации
Почетный знак Центральной избирательной комиссии Российской Федерации «За заслуги в организации выборов»
Наградное оружие директора ФСБ России
Почетная грамота Федеральной службы по надзору в сфере природопользования