Игорь Заболотный родился 26 июня 1967 года в городе Москва. Закончил московский технический университет связи и информатики по специальности инженер электросвязи. После первого курса Игоря призвали в армию. Службу проходил в войсках связи на Западной Украине.
В 1994 году получил второе высшее образование во Всероссийском институте промышленной собственности и инноватики по специальности патентовед. В 1996 году занимался разработкой системы ГАС «Выборы». С 1998 года занимает руководящие должности в крупнейших российских компаниях связи.
В 1998-1999 годах Игорь Заболотный работал исполнительным директором ОАО «Ростелеком». С 1999 по 2002 год занимал должность директора департамента маркетинга и организации продажи услуг ОАО «Инвестиционная компания связи». 14 ноября 2002 года Игорь Заболотный решением совета директоров назначен временным генеральным директором ОАО «Дальсвязь», а с 24 декабря 2002 г решением общего собрания акционеров избран генеральным директором. После прекращения полномочий генерального директора продолжил своё участие в деятельности компании в качестве члена Совета директоров.
В 2005 году получил степень мастера делового администрирования в Академии народного хозяйства при правительстве РФ.
В 2005 году 14 марта Игорь Заболотный назначен заместителем генерального директора крупнейшего российского поставщика услуг спутниковой связи ФГУП «Космическая связь». По официальному заявлению ГПКС, назначение связано с необходимостью реализации на российских и зарубежных рынках появившейся «спутниковой ёмкости» компании. Заболотный также является членом Совета Директоров ЗАО «Акос», одного из пяти операторов сотовой связи Приморья.
С августа 2007 года - заместитель генерального директора, а затем генеральный директор ОАО «Межрегиональный ТранзитТелеком». По мнению аналитиков, перед Заболотным на этом посту стояла задача «сохранения бизнеса в условиях насыщенного высококонкурентного телекоммуникационного рынка Москвы…и неблагоприятной экономической конъюнктуры».
2 июля 2009 года Игорь Заболотный вступил в должность генерального директора «Центрального телеграфа». В 2011 году срок полномочий был продлен до 2013 года. Пресс-служба оператора сообщала, что переизбрание связано «с задачами реформирования ОАО „Связьинвест“». В декабре 2012 года совет директоров компании отправил его в отставку. Работал в Центральной избирательной комиссии РФ.
В 2010 году Игорь Заболотный организовал благотворительную акцию «телеграмма против террора» по обеспечению москвичей средствами защиты и первой помощи. Акцию поддержала газета «Московский комсомолец», Интерфакс и другие крупные СМИ. Акция была приурочена к 40-му дню после взрывов в московском метро. Под руководством Заболотного организована поддержка школ для детей с ограниченными возможностями.
Является членом-корреспондентом Академии телекоммуникаций и информатики, академиком Международной академии качества телекоммуникаций.
По мнению Заболотного, страны СНГ были и по духу остались одной страной. Принципиально не выделяет отдельные приемные дни, так как «это правильно, когда руководитель тратит 90 процентов времени на людей, а не на документы и технику». Любит книги Сергея Довлатова, увлекается фотографией.