Исмагил Зайдуллин родился в 1905 году в городе в Батуми, Грузия. После окончания Санкт-Петербургского военно-морского института пошел служить на флот. В 1930-е годы занимался увеличением автономности подводных лодок, повышая дальность и продолжительность их походов.
В 1936 году его подлодка «Угорь», выйдя из Владивостока, провела в море семьдесят пять суток, в три раза превысив штатную продолжительность плавания. В августе 1938 года Зайдуллин арестован и год провел в тюрьме. Его и других командиров бригады обвинили в измене Родине, шпионаже и контрреволюционном заговоре, диверсиях и вредительстве. Подводнику повезло: репрессии к тому времени пошли на спад, и военный трибунал во Владивостоке дал три года и тут же амнистировал его, освободив прямо в зале суда.
После освобождения, в октябре 1939 года Исмаил Зайдулин назначен исполняющим дела командира подводной лодки «Д-2» Северного флота. Через семь месяцев утвержден в этой должности. За короткий срок завоевал авторитет грамотного, решительного и смелого командира.
В соответствии с приказом наркома Военно-морского флота 23 мая 1940 года начала формироваться экспедиция особого назначения по переводу в навигацию подводной лодки «Щ-423» из Полярного во Владивосток Северным морским путем». Практически сразу же после назначения для арктического похода, 25 мая «Щ-423» перешла из пункта базирования в Полярном в Мурманск к стенке завода «Севморпуть», где в обстановке строгой секретности ее стали готовить к трансполярному переходу.
Корпус «Щ-423» начали обшивать толстой противоледовой деревянно-металлической «шубой», которая должна сберечь корпус «щуки» от непосредственного воздействия льда. Тут же на заводе проведены и другие доработки: заменены бронзовые винты «щуки» на стальные, имеющие съемные лопасти, сняты носовые и кормовые горизонтальные рули. Их заменили на специальные съемные кормовые рули на укороченном баллере, которые во время перехода можно снимать и ставить назад при помощи водолазов. Также сняты волнорезные щиты носовых и кормовых торпедных аппаратов. Одновременно с корпусными работами на «Щ-423» установлен эхолот ЭМС-2 и переносной радиопеленгатор «Пассат».
Приказом наркома Военно-морского флота 14 июня 1940 года командиром подводной лодки «Щ-423» назначен капитан 3-го ранга Исмаил Зайдуллин, а штатный командир «Щ-423» капитан-лейтенант А.М. Быстров - его дублером. На следующий день принял под свое командование подводную лодку «Щ-423». Личный состав под его руководством занимался переборкой механизмов, получением текущего и зимовочного запасов.
Подводная лодка «Щ-423» 9 июля вернулась в Полярный для замены аккумуляторных батарей и проверки торпедных аппаратов, а 22 июля вышла в Мотовский залив на ходовые испытания после обшивки корпуса противоледовой «шубой» и установки специальных «ледовых» кормовых горизонтальных рулей. Подводная лодка погружалась на глубину 45 метров. К 25 июля вся подготовка «Щ-423» и ее экипажа к переходу через арктические моря была закончена.
«Щ-423» под командованием Зайдуллина вышла в море 5 августа 1940 года. В дальний поход ее провожало все высшее командование Северного флота. Лодка шла не одна - ее сопровождал транспортный пароход «Александр Серов», а в проливе, соединяющим Баренцево море с Карским, ждал ледокол «Ленин».
Через две недели плавания лодка достигла полуострова Таймыр и вошла в море Лаптевых. Здесь «экспедиции особого назначения» пришлось преодолевать многолетние нетающие льды, пытаясь найти проходы между торосами, достигавшими 3-4 метров толщины. Сменяя друг друга, впереди попеременно шли три ледокола - «Ленин», «Сталин» и «Литке». Самой сложной задачей стало пройти в районе так называемого Айонского ледового массива - его многолетние, никогда не тающие льды протянулись не на одну сотню километров севернее Чукотки. Подлодке и ледоколам пришлось пройти почти две тысячи километров во льдах вдоль чукотского берега.
Лодка постоянно шла в ледяной воде при заполярных морозах, к холоду добавлялась повышенная влажность, неизбежная в море на таком судне. Конденсация влаги выводила из строя электропроводку, в отсеках стоял настоящий туман. В условиях постоянной ледовой опасности командованию лодки приходилось почти неотлучно находиться на открытом, продуваемом полярными ветрами мостике.
Через тридцать семь суток «ледяного похода» 9 сентября 1940 года лодка пришла в бухту Проведения на Чукотке. Чтобы понять насколько субмарина сохранила боеспособность после пяти тысяч километров в Северном Ледовитом океане, капитан Зайдуллин приказал провести полное погружение. Под водой с поднятым перископом «Щ-423» вошла в долгожданную бухту.
Северный морской путь успешно пройден, но субмарине предстояло еще более четырех тысяч километров до Владивостока по бурному в это время года Тихому океану. Поэтому в бухте Провидения экипаж капитана Исмаила Зайдуллина шесть суток занимался осмотром и ремонтом механизмов, прежде чем пройти Берингово, Охотское и Японское моря.
Лишь на рассвете 17 октября 1940 года лодка «Щ-423» встала на якорь в бухте Золотой Рог. Ее моряки впервые за семьдесят четыре дня увидели огни большого города - Владивосток стал конечным пунктом небывалой в мире северной одиссеи подводного корабля. Исмаилу Матигуловичу 7 ноября присвоено звание капитана 2 ранга.
Измаил Зайдуллин сражался с первого дня Великой Отечественной войны, командуя подводными лодками и торпедными катерами на Черном море и Балтике. Человек резкий и острый, даже на войне не изменил себе - получал как награды, так и взыскания. В феврале 1944 года боевой капитан «за нарушение воинской дисциплины» разжалован в рядовые и направлен в штрафники.
Три месяца штрафной капитан провоевал рядовым матросом на одном из малых катеров. Когда же летом 1944 года началось наступление на финском фронте, Зайдуллина вернули командовать кораблями, сражавшимися в Выборгском заливе.
Исмаил Матигулович Зайдуллин погиб 22 августа 1944 года в результате трагической случайности. В условиях плохой видимости наши самолеты атаковали наши же катера, перепутав их с противником. На одном из катеров находился капитан 2 ранга.
Зайдуллин посмертно награжден орденом Отечественной войны I степени, а 15 октября 1944 года посмертно присвоено воинское звание капитана 1 ранга.
В 2015 году на Серафимовском кладбище Санкт-Петербурга открыли небольшой памятник Измаилу Зайдулину.
В Центральном военно-морском музее стоят модель подлодки Щ-423 в «противолёдной шубе» и бюст её легендарного командира.
22 ноября 2019 года Безымянному мысу в Кингисеппском районе Ленинградской области присвоили имя Исмаила Зайдулина
Был женат.
Старший сын - Джемал, пошёл по стопам отца - будучи курсантом Высшего военно-морского училища, он прошёл на подлодке Севморпутём. Стал командиром атомной подлодки, имел орден Красной Звезды.
Младший сын - Рустэм, дослужился до капитана 1-го ранга.