Жан-Поль Марат родился 24 мая 1743 года в городе Будри, Швейцария. Мальчик получил хорошее образование в доме отца, довольно известного врача. Потеряв родителей, зарабатывал на жизнь уроками и врачебной практикой, переезжая из города в город. Являлся врачом и работал при дворе графа Д’Артуа, будущего короля Франции Карла X.
Марата имел степень доктора медицины, однако же те, кто читал его работы об огне и электричестве, вынуждены признать, что ученый имел знания во многих областях науки. Но более всего его интересовали проблемы человека и социума. Жан-Поль даже представил свой план уголовного законодательства, некоторые идеи которого восприняты и применены к действительности Иосифом II, императором священной Римской империи. В частности, Марата очень беспокоило право собственности кого-то на избыток благ, в то время как другим этих благ не хватало. Также считал насущной необходимостью перемену государственного строя. В издаваемой им газете «Друг народа» обличал социальную несправедливость и призывал к насильственному свержению власти. И его мечты вскоре осуществились.
В 1789 году со взятия Бастилии началась Великая Французская Революция. После переворота Марат входил в Национальный Конвент, единственный орган власти в революционной Франции. Революционеры делились на три лагеря: радикально настроенных якобинцев, к которым принадлежал Марат, аморфных центристов и жирондистов, которые не соглашались с террористическими методами. Последние постоянно преследовали Марата, и даже предали его суду за призывы к насилию. Марата оправдали, но конфликт от этого только обострился. К тому же после этого всю свою деятельность направил на уничтожение жирондистов.
В 1793 году Марат уже тяжело болел, начала прогрессировать кожная болезнь, которой заразился, когда лечил и выхаживал английских бродяг. Чтобы хоть как-то облегчить свои страдания, постоянно сидел в ванной, писал там и даже принимал посетителей. Именно в ванной комнате 13 июля 1793 года Жан-Поль Марат оказался заколот ярой поклонницей жирондистов, дворянкой Шарлоттой Корде.
Через три дня его тело было похоронено в саду клуба Кордельеров в торжественной обстановке; сердце покойного извлечено и помещено в зале заседаний клуба. В честь Марата ненадолго переименованы Монмартр и город Гавр. Однако 21 сентября 1794 года его останки были перенесены в Пантеон. Через год, 8 февраля 1795 года останки убрали и перезахоронили 26 февраля на кладбище у церкви Сент-Этьен-дю-Мон.
После Октябрьской революции 1917 г. в России имя Марата увековечено в названии многих объектов в СССР. В Москве существовали Большой и Малый Маратовские переулки (ранее Курбатовы, ныне Ордынские), названные по кондитерской фабрике имени Марата.
В Санкт-Петербурге есть улица Марата. Улица Марата есть также в Нижнем Новгороде, Новороссийске, Новосибирске, Пензе, Севастополе, Курске, Калининграде, Екатеринбурге, Омске, Иркутске, Красноярске, Ижевске, Перми, Ульяновске, Минске, Орше, Мурманске, Краматорске, Тайшете, Туле, Калуге, Мичуринске, Уфе[7], Калинковичах и др.
В 1921 году именем «Марат» назван флагман Краснознаменного балтийского флота, бывший линкор «Петропавловск». (В 1943 г. линкору возвращено его прежнее название).
В СССР выходили биографии Марата (например - в серии ЖЗЛ и серии ПР), а также публиковались некоторые его произведения.