Между Россией и Эстонией, 26 сентября 1995 года был подписан акт о передаче эстонским властям ядерного объекта российских вооруженных сил - учебного центра подводного флота в Палдиски. До 1991 года экипажи советских атомных подводных лодок проходили обучение в трех учебных центрах - Палдиски, Севастополь, Сосновый Бор.

Учебный центр в Эстонии обладал двумя действующими реакторами подводных лодок первого и второго поколений - «Дельта-I» и «Эхо-II», а также уникальным тренажером для подготовки экипажей атомных подводных лодок класса «Тайфун», «Янки» и «Дельта-I-IV», размещенных в Палдиски в 1960-х и в 1980-х годах.

Реакторы в учебном центре подводного флота были заглушены в 1989 году. Российская армия, выводя войска из Эстонии, извлекла из реакторов топливные стержни, однако реакторы по-прежнему представляли опасность для территории, на которой были размещены. И поэтому было принято решение, запечатать их в специальные бетонные саркофаги.

Для этих целей в 2003 году Европейский Союз выделил Эстонии около 1,8 миллиона долларов на обеспечение безопасности в Палдиски в качестве безвозмездной помощи в рамках европейской программы PHARE. Бюджет самой Эстонии на данный проект составил около 130 тысяч долларов.