В городе Иерусалим 15 марта 2005 года состоялось открытие нового Музея истории холокоста. Старый музей, работавший с 1957 года, был заменен на новый, в четыре раза больший. Эта замена диктовалась не только неуклонным ростом фондов. Было решено применить более выразительные средства воздействия для сохранения прежней остроты восприятия холокоста.

Музей находится на холме с сосновыми деревьями, и из окон мемориала открывается удивительный вид на город. Помещение выполнено в виде тоннеля внутри холма. По обе стороны тоннеля ответвляются залы, в них отображается хронология еврейских гонений в нацистской Германии. Продвигаясь по тоннелю, посетители как бы наполняются чувством загнанности, которое испытывали жертвы геноцида.

К концу уровень пола начинает подниматься, стены раздвигаться, а повествования о погибших сменяются рассказами об уцелевших. Наконец, посетители выходят на белый свет и видят несравненную панораму Иерусалима. На перестройку старого музея Яд Вашем ушло 56 миллионов долларов. Дизайн нового мемориала был разработан архитектором Моше Сафди.

Новый музей фокусирует внимание посетителей на личных историях людей, ставших жертвой геноцида. В музее выставлены дневники, фотографии и личные вещи очевидцев тех трагических событий. В музее есть Зал имен, где собраны фамилии трех миллионов погибших в нацистских концлагерях, а также 600 их фотографий. Есть у музея и веб-сайт, где можно найти биографии многих жертв Холокоста.

Целями Яд Вашем являются образование, изучение, документирование и увековечение. Комплекс организует курсы профессионального развития для работников сферы образования как в Израиле, так и по всему миру, разрабатывает учебные программы, курсы и учебные пособия для Израиля и зарубежных школ, адаптированные к возрастным категориям, с целью преподавания темы Холокоста учащимся всех возрастов.

Музей проводит посвященные Холокосту выставки, собирает имена жертв Холокоста, собирает фото, документы и личные артефакты, а также собирает Листы Свидетельских показаний, увековечивающие жертв Холокоста. Яд Вашем стремится сохранить память о шести миллионах евреев, уничтоженных во время Холокоста, и бесчисленных еврейских общинах, разрушенных в этот период, сохранить их имена и названия.

Музей проводит церемонии воспоминания и увековечения, поддерживает посвященные Холокосту исследовательские проекты, подготавливает и координирует симпозиумы, семинары и международные конференции, а также публикует связанные с Холокостом исследования, мемуары, документы, альбомы и дневники. Яд Вашем также отдает дань уважения не-евреям, рисковавшим своей жизнью ради спасения евреев во время Холокоста.

Международная школа-институт исследований Холокоста в Яд Вашем, основанная в 1993 году, предлагает руководства и семинары для студентов, учителей и работников сферы образования, а также разрабатывает педагогический инструментарий для применения в учебных классах. Яд Вашем ежегодно обучает 10 000 учителей в стране и за рубежом.

Организация поддерживает интернет-сайт на нескольких языках, включая немецкий, иврит, фарси и арабский. В 2013 году Яд Вашем запустил онлайн-кампанию по продвижению веб-сайта Яд Вашем на арабском языке. Кампания достигла аудитории в более чем 2,4 миллиона арабо-говорящих пользователей по всему земному шару.

Политика учреждения состоит в том, что Холокост «нельзя сравнить ни с каким другим событием». В 2009 году Яд Вашем уволил преподавателя за сравнение травмы, пережитой евреями во время Холокоста, с травмой, пережитой палестинцами во время израильской Войны за независимость, включая резню в Дейр-Ясине.