На Поместном соборе Русской Православной Церкви в Москве 7 июня 1990 года был выбран новый Патриарх Московский и Всея Руси. Им стал митрополит Ленинградский и Новгородский Алексий, в миру - Алексей Михайлович Ридигер, принявший имя Алексия II. В тот же день колокол Троице-Сергиевой лавры возвестил об избрании пятнадцатого Всероссийского Патриарха.

Интронизация Патриарха состоялась 10 июня 1990 года в столичном Богоявленском кафедральном соборе. Алексий II был выдающимся церковным иерархом рубежа 20-21 веков. Он взял на себя тяжкую миссию возрождения и укрепления Церкви. Все труды Святейшего Патриарха увенчивались успехом и приносили благодатные плоды.

Благодаря его стараниям произошло объединение Русской Православной Церкви и Русской Православной Церкви за рубежом, он объездил с пастырскими визитами множество епархий и церквей, везде утверждая Святое Православие, стараясь подбодрить людей и укрепить их веру.

Патриарх был награжден орденом «За заслуги перед Отечеством» I степени, орденом Петра Великого, общественным орденом Минина и Пожарского «Возвеличим Россию» за большой личный вклад в укрепление Российского государства, возрождение духовной силы Отечества. В 2005 году Алексию II была вручена премия «Человек года».

В июне того же года Священный Синод РПЦ наградил его Орденом Славы и Чести - в ознаменование 15-летия первосвятительских трудов «на благо Церкви и Отечества». Патриарх также был лауреатом международной премии «Голубь мира» за неустанную миротворческую деятельность в целях достижения мира и согласия между народами.