Управление Федеральной службы безопасности по Краснодарскому краю является органом исполнительной власти, спецслужба, осуществляющая в пределах своих полномочий решение задач по обеспечению безопасности в регионе. Входит в единую централизованную систему органов Федеральной службы безопасности. Управление осуществляет свою деятельность по направлениям: контрразведывательная деятельность; борьба с терроризмом; разведывательная деятельность; пограничная деятельность; обеспечение информационной безопасности; борьба с преступностью; иная деятельность определенная федеральным законодательством. Начальник управления ФСБ России по Краснодарскому краю - Захарихин Сергей Борисович.
27 марта 2020 года ФСБ России предотвращен террористический акт в Краснодаре. В результате проведенных мероприятий задержан причастный к подготовке данного преступления гражданин России 1993 года рождения. В его автомобиле обнаружено самодельное взрывное устройство, а в используемых средствах связи переписка с находящимися за рубежом членами запрещенной в РФ международной террористической организации «Исламское государство». По результатам экспертиз предметов и документов будет принято соответствующее процессуальное решение.