Сахалинская таможня обеспечивает реализацию задач и функций Федеральной таможенной службы России, в том числе исполнения функций органа валютного контроля, в регионе деятельности в пределах полномочий, определенных настоящим положением. Осуществляют свою деятельность во взаимодействии с территориальными органами власти, местного самоуправления, юридическими и физическими лицами. В структуре Сахалинской таможни - 5 постов, 1 служба, 16 самостоятельных отделов, 10 самостоятельных отделений, здравпункт. Входит в состав Дальневосточного таможенного управления.
Руководство Сахалинской таможни
Холичев Виктор Михайлович
Начальник Сахалинской таможни, генерал-майор таможенной службы
Рябцев Евгений Иванович
Первый заместитель начальника Сахалинской таможни по таможенному контролю, полковник таможенной службы
Колоскова Ирина Вячеславовна
Заместитель начальника Сахалинской таможни, майор таможенной службы
Сульдимиров Евгений Валентинович
Заместитель начальника таможни, полковник таможенной службы
Рева Денис Русланович
Заместитель начальника Сахалинской таможни по работе с кадрами, начальник отдела государственной службы и кадров, полковник таможенной службы
Бояринов Андрей Николаевич
Заместитель начальника Сахалинской таможни, полковник таможенной службы