Управление Федеральной службы безопасности по Сахалинской области является органом исполнительной власти, спецслужба, осуществляющая в пределах своих полномочий решение задач по обеспечению безопасности в регионе. Входит в единую централизованную систему органов Федеральной службы безопасности. УФСБ осуществляет свою деятельность по направлениям: контрразведывательная деятельность; борьба с терроризмом; разведывательная деятельность; пограничная деятельность; обеспечение информационной безопасности; борьба с преступностью; иная деятельность определенная федеральным законодательством. Начальник управления ФСб России по Сахалинской области - Потоцкий Андрей Юрьевич.

23 марта 2020 года сотрудники УФСБ России по Сахалинской области задержали двух студентов, причастных к пропаганде в интернете массовых убийств и планировавшие теракт в техникуме. Во время обысков изъят обрез охотничьего ружья с патронами, предположительно самодельные взрывные устройства, промышленный детонатор, взрывчатые вещества, средства связи и личные дневники с планами вооруженного нападения на учебное заведение. Возбуждено уголовное дело по части 2 статьи 205.2 УК РФ. По результатам экспертиз оружия, боеприпасов и документов могут быть приняты дополнительные процессуальные решения о возбуждении дел по иным статьям.